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一种基于多模态数据融合的恶性肝肿瘤分类方法 

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申请/专利权人:智药元创医学技术(上海)有限公司

摘要:本发明涉及一种基于多模态数据融合的恶性肝肿瘤分类方法,通过对非结构化多期CT影像数据的规范化预处理,对结构化的信息进行离散化处理,构建基于卷积神经网络的空间特征提取模块,以及基于门控循环神经网络的时序信息编码模块,并通过多模态数据融合模块,结合非结构化的影像数据与结构化的信息,最终得到深度学习恶性肝肿瘤分类。与现有技术相比,本发明在卷积神经网络的基础上,引入门控循环神经网络,有效挖掘多期造影增强CT的空间时序特征,并使用多模态数据融合将影像特征与临床数据结合,能够显著提高区分肝细胞癌HCC,肝内胆管癌ICC和转移性肝癌的准确度。

主权项:1.一种基于多模态数据融合的恶性肝肿瘤分类方法,其特征在于,包括下列步骤:1)数据集获取:收集收集病理确诊的HCC、ICC和转移性肝癌患者术前临床信息及CECT图像,并将采集的样本数据划分训练集样本和测试集样本;2)CECT图像预处理:从图像存档和通信系统导出包括平扫期、动脉期和门脉期的CECT图像,对CECT图像进行预处理形成训练影像库;3)临床数据编码:对样本的年龄、性别、血小板、总胆红素、甲胎蛋白、糖类抗原19-9、癌胚抗原、糖类抗原125和乙型肝炎表面抗原进行数据编码;4)模型架构:基于空间特征提取-时序特征编码-特征集成-分类器模块化设计思想,构建一个深度学习模型;5)模型训练:对CECT图像预处理后的图像进行动态数据增强,以确保图像中肿瘤位置的一致性;基于训练影像库及编码后的临床信息进行模型训练;6)模型处理及预估:将预处理后的多期CECECT图像和相应的编码临床数据输入训练后的深度学习模型,输出每种类型的肝脏恶性肿瘤的可能性分值,并基于准确度、微平均AUC和宏平均AUC对输出结果进行评估;所述深度学习模型包括:空间特征提取模块,该模块为全卷积网络,通过采用卷积层提取CECT图像的详细空间特征;时序特征编码模块,采用RNN挖掘不同期CECT之间的变化模式;特征集成模块,将时序特征编码模块的输出与编码后的临床数据进行融合;分类器模块,将特征集成模块的输出通过softmax激活函数,实现对肝脏恶性肿瘤的分类;所述深度学习模型将预处理后的多期CECT图像和相应的编码临床数据作为输入,并最终输出每种类型的肝脏恶性肿瘤的可能性分值;空间特征提取模块利用在ImageNet上预训练的VGG16卷积层提取CECT图像的空间特征,并运用核大小为7×7的可训练卷积层输出长度为128维的特征;再通过时序特征编码模块利用RNN挖掘肝肿瘤在不同期CECT中的变化模式,利用GRU捕捉时序多期影像中的依赖关系,构建具有一层特征维度为32的GRU的RNN;随后,在特征集成模块中,将时序特征编码模块的输出与编码后的临床数据哑变量连接,融合成52维的特征;最后,在分类器模块中,将特征集成模块的输出通过softmax函数进行激活,得到每一类的概率数值,概率数值最大的为预测类别,进而实现肝脏恶性肿瘤的分类任务。

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