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申请/专利权人:上海生物芯片有限公司
摘要:本申请提供KEGGPathwaymap组学维度信息的交互式展示方法、系统、终端、介质,本发明通过对KEGGPathwayMap中元素的填充色、边框和单词或数字进行颜色映射的方式同时批量展示单一或多组学元素的变化水平、表达水平、显著水平、各种修饰水平如甲基化水平或突变频率等信息;同时依据html规则与JavaScript脚本以网页版的形式交互式地突出展现某个组学、维度信息。本发明可以同时批量、交互式、清晰具体地在KEGGPathwayMap展示各组学、维度信息。
主权项:1.一种KEGGPathwaymap组学维度信息的交互式展示方法,其特征在于,包括:根据已知的目标组学在多个维度上的取值情况构建各维度的阈值范围,并将所述目标组学在各维度上的值转换为对应的颜色代码;其中,目标组学的多个维度包括:表达水平、表达变化水平、显著性、甲基化程度、突变频率、磷酸化或泛素化水平、拷贝数变化;根据所述颜色代码,将各组学各维度的颜色映射图例组合绘制为原始图片;基于KGML文件信息解析所述pathway通路图,以获取各所述目标组学的坐标信息;根据所述目标组学的坐标信息以及各目标组学所对应的颜色代码,在未进行着色修改的所述原始图片上选择感兴趣的组学和感兴趣的维度进行着色修改后展示。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 上海生物芯片有限公司 KEGG Pathway map组学维度信息的交互式展示方法、系统、终端、介质
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