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申请/专利权人:西北农林科技大学
摘要:本发明公开了一种检测秦川牛GBP2基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以秦川牛的血液全基因组DNA为模板,利用两对特异引物GBP2‑CNV1和GBP2‑CNV2分别扩增牛GBP2基因的两个拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增秦川牛BTF3基因作为对照,然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在秦川牛GBP2基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上,有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
主权项:1.一种检测秦川牛GBP2基因CNV标记的方法,其特征在于:包括以下步骤:利用实时定量PCR,以秦川牛基因组DNA为模板,以引物对GBP2-CNV1和GBP2-CNV2为引物,分别扩增GBP2基因的两个拷贝数变异位点CNV1和CNV2的片段,同时以引物对R1为引物扩增作为内参的BTF3基因的部分片段,然后根据定量结果鉴定秦川牛GBP2基因的拷贝数变异类型;所述的引物对GBP2-CNV1为:上游引物F1:5’-CTCTCAGGCGGTATCACAGTCAATG-3’下游引物R1:5’-TCCTTGGCATCATTAGACTCTGTAT-3’;所述的引物对GBP2-CNV2为:上游引物F2:5’-ATGGGCAGCCTGGACTATC-3’下游引物R2:5’-GGTTCTCCTTGGACGGGTG-3’;所述的引物对R1为:上游引物F3:5’-AACCAGGAGAAACTCGCCAA-3’下游引物R3:5’-TTCGGTGAAATGCCCTCTCG-3’。
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权利要求:
百度查询: 西北农林科技大学 一种检测秦川牛GBP2基因CNV标记的方法及其应用
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