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一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型、构建方法及应用 

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申请/专利权人:中国人民解放军陆军特色医学中心

摘要:本发明涉及一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型、构建方法及应用,通过MALDI‑TOFMS对VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的质谱蛋白特征峰进行分析,建立区分两种亚型的识别模型;通过该识别模型可快速准确地鉴别VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌,具有操作简便,耗时短等优点,因此,这为MALDI‑TOFMS鉴定细菌亚型的研究提供了全新的思路,具备非常广的应用前景。

主权项:1.一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型的构建方法,其特征在于,具体步骤如下:1首先将VIM型和SPM型菌株质谱结果导入SARAMIS数据库,通过对两者质谱峰进行聚类分析,发现两者之间存在部分有差异的质谱峰;然后通过LaunchPad软件将两者质谱峰进行比较分析,得到17个高信号强度峰作为两者的共有质量峰;2为筛选VIM型和SPM型菌株之间有差异的特征峰,再次利用LaunchPad软件分别比较VIM型菌株和非VIM型以及SPM型菌株和非SPM型的质谱特征峰;3最后选取VIM型菌株的4个特征峰和非VIM型菌株的3个特征峰作为鉴定VIM型的模型,选取SPM型菌株的2个特征峰和非SPM型菌株的2个特征峰作为鉴定SPM型的模型;步骤1中,所述的17个高信号强度峰包含:3601mz,4434mz,4544mz,4849mz,4992mz,5114mz,5210mz,5737mz,6046mz,6348mz,6676mz,7203mz,7595mz,8786mz,9089mz,9987mz和10229mz;步骤3中,VIM型菌株的4个特征峰为:3230mz,3409mz,5450mz,7329mz,非VIM型菌株的3个特征峰为3429mz,5490mz,7390mz;步骤3中,SPM型菌株的2个特征峰为3663mz,6264mz,非SPM型菌株的2个特征峰为4068mz,4282mz。

全文数据:

权利要求:

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