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申请/专利权人：上海市农业科学院

摘要：本发明涉及一种香菇TW1151菌种的InDel标记指纹图谱及其构建方法，该指纹图谱由7对基于香菇全基因组测序后开发的InDel标记组成。本发明的香菇TW1151菌种的InDel标记指纹图谱可用于香菇TW1151菌种的特异性鉴定，具有检测时间短、准确性高、可重复性好的优点，在收集的44个香菇菌种中具有香菇TW1151菌种的专一性。

主权项：1.一种用于鉴定香菇TW1151菌种的方法，其特征在于利用以下7对InDel标记引物组合，对香菇菌种进行扩增，将得到的带型与TW1151菌种的带型对照，与该带型一致即为香菇TW1151菌种；其中香菇TW1151菌种的带型编号组合为：121+211+21+21+2；其中引物Lefp_id001对应的编号是第一对带型1，其中1对应的是203bp；引物Lefp_id002对应的编号是第二对带型2，其中2对应的是214bp；引物Lefp_id003对应的编号是第三对带型（1+2），其中1对应的是265bp，2对应的是248p；引物Lefp_id004对应的编号是第四对带型1，其中1对应的270bp；引物Lefp_id005对应的编号是第五对带型（1+2），其中1对应的是378bp，2对应的是346bp；引物Lefp_id006对应的编号是第六对带型（1+2），其中1对应的是277bp，2对应的是262bp；引物Lefp_id007对应的编号是第七对带型（1+2），其中1对应的是284bp，2对应的是264bp；7对InDel标记引物序列5′-3′如下：Lefp_id001正向引物：ACGGATGGAGAGACACAGGA反向引物：TGCCCCACTTACTCTCAACCLefp_id002正向引物：CCTTTCTCAAAAGCGGACTG反向引物：GGGAGTGGGTTGTTTGGATALefp_id003正向引物：CGGATGTTATGCACTGGAAG反向引物：CGTACGGTTGGACATTTGAALefp_id004正向引物：AGCCTTTCACAGTCAGCTCG反向引物：GTCAACGGAGGGAAACAGAGLefp_id005正向引物：GTAGCACTCCTCATACAACC反向引物：ACCAAATGTCACAGCACAGGLefp_id006正向引物：ACATTGGCGAAGGCTGTACG反向引物：CCCTTTTGCCCTATAAGGCGLefp_id007正向引物：AACAGTAACCTGTGCACTGC反向引物：CATGATCAGATCACACAGCG。

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权利要求：

百度查询： 上海市农业科学院 一种香菇TW1151菌株的InDel标记指纹图谱及其构建方法