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检测德国牧羊犬犬种的引物组、试剂盒、基因芯片和方法 

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申请/专利权人:北京中科昆朋生物技术有限公司;中国科学院昆明动物研究所

摘要:本申请提供检测德国牧羊犬犬种的引物组、试剂盒、基因芯片和方法,其中所述检测德国牧羊犬犬种的方法包括:采集待检测犬的基因信息;对所述基因信息进行扩增,通过预设引物组对扩增后的基因信息进行检测,获得预设数量的待检测基因位点信息集合;将所述待检测基因位点信息集合与参考基因位点信息集合进行比对;根据比对结果确定所述待检测犬对应的德国牧羊犬犬种信息。通过本方法,利用少量高频基因突变位点鉴定德国牧羊犬的方法,直接获得鉴定结果,不用依赖相关鉴定人员的鉴定经验,检测准确性高、可重复性高,鉴定时间短。

主权项:1.一种检测德国牧羊犬犬种的引物组,其特征在于,所述引物组包括如下至少一个引物对:1第1引物对,用于检测3号染色体、第18998107位点,包括:上游引物5'-TGGTACACATAGTAAAACATAGAATACAACTTTGT-3';下游引物5'-ATAGATTAGAAATAAGAAAATACATATAAGACAAT-3';2第2引物对,用于检测3号染色体、第33696784位点,包括:上游引物5'-AAGGATGTTATCGCGAGTCCGTTATATACTTTAAA-3';下游引物5'-CCCCCCTGAGAATCTTAAGTTATAATTGTATCGTA-3';3第3引物对,用于检测3号染色体、第38051733位点,包括:上游引物5'-TAATGAAACCAGTCCCTAATTTGGGCAGAAACTGC-3';下游引物5'-ACTGTTGAAAGGGCCACAATGTAGAAGATTCTGTT-3';4第4引物对,用于检测3号染色体、第42150202位点,包括:上游引物5'-TGACTCAGAGGTTATTACAGTGAAAAGGTTCCATC-3';下游引物5'-GAAACCCTGAGTGAGTGGGGTAAGGAAACGAAAAG-3';5第5引物对,用于检测3号染色体、第56443494位点,包括:上游引物5'-AAAGGTAGTAACTGTACGAGAAGTGGCACCGGTCG-3';下游引物5'-AGGACGAGTATCTGAAGAAGGCCCCTGAAAAACAG-3';6第6引物对,用于检测3号染色体、第64248843位点,包括:上游引物5'-AACGTAGTAATAGACACAAGATGTTATAGTGAAGA-3';下游引物5'-AGGAATGTGTAAACATTACGTTGGATCAGTTATCT-3';7第7引物对,用于检测3号染色体、第64859283位点,包括:上游引物5'-AAACTTCAGAAGAAGACAGACGGGTGGAGACGCTG-3';下游引物5'-AGTAACAAAAGCGACTTGAGGAAACTTTTTTTACG-3';8第8引物对,用于检测3号染色体、第66488716位点,包括:上游引物5'-ATCGGTTTCTTCGGTGATTACACGGTAGCCAACGG-3';下游引物5'-GACCCGGTACACTACTACTTCCTTAGCATTGATCG-3';9第9引物对,用于检测3号染色体、第66506192位点,包括:上游引物5'-GCTTATGTCGTCGCCGCTTCGACGATCACTTTTCT-3';下游引物5'-CCTCGTCTTACTGCTACTGTTGTACTTCAGAGTCC-3';10第10引物对,用于检测3号染色体、第66511812位点,包括:上游引物5'-AAAAGCAAAAGAATTTCTACTCAGGTTATTTCTTT-3';下游引物5'-GTGATGGGGTGTTCTTTCTTCATACTCGTTGCATT-3';11第11引物对,用于检测4号染色体、第81217530位点,包括:上游引物5'-TGTAGTTCGTAGACTTTTCGATAGGAGGTAGAGTG-3';下游引物5'-TGCATCAAAAGTGTCCAAAGAGAACAAAACCAGAA-3';12第12引物对,用于检测7号染色体、第12810181位点,包括:上游引物5'-TACATTATCATCAAACATGTATAACCGATCTAAAA-3';下游引物5'-GGAGAGGGTCTCACCCAAACCAAGAAGAAAGGGTA-3';13第13引物对,用于检测15号染色体、第32846807位点,包括:上游引物5'-GGCTTCTGTTTACTCAAACTTTAGTTTTCGTTTCG-3';下游引物5'-TGTTCTTCTTTATTTGTACATGTCTTCGATAGTGG-3';14第14引物对,用于检测18号染色体、第32601829位点,包括:上游引物5'-ACACTCGGTACATGTCTACACTGGAAAATTTCTAG-3';下游引物5'-GGACGTCTTTAGTCTACAGAGGAATTGTTCCATTA-3';15第15引物对,用于检测21号染色体、第14897996位点,包括:上游引物5'-CACTTAATTGCACGCGGTCGACAACGGATGGTCCA-3';下游引物5'-CCTCACCCAGTCTTACTGGACACCGGAAGTTACTT-3';16第16引物对,用于检测21号染色体、第23162761位点,包括:上游引物5'-GGGAGTCCTTCCGTCCGAGGTCTCGTGACTCCGGC-3';下游引物5'-ACCCTAAGCCTACTAAGACCTACCTCCCTGGGGCG-3';17第17引物对,用于检测24号染色体、第9397982位点,包括:上游引物5'-TCCGACCAGATTTAATCTTAGGTCCGTAACGACAC-3';下游引物5'-GGACATAAAGGTAGTGTGTGTCAGGGGTGTACACT-3';18第18引物对,用于检测27号染色体、第9784191位点,包括:上游引物5'-AAAACAGAACTAAGAGGTACGGAACGAGTAAAAAG-3';下游引物5'-CTTTGGCAGGTTTCTTGGTTTACTTCTTAGGTTTG-3';19第19引物对,用于检测27号染色体、第10390260位点,包括:上游引物5'-ACGACGATTCGAAAAACCGACCTCAAAGACGACAA-3';下游引物5'-ACAATGAGTCTTAGAAAGTAACCAGCAGAGTCAGA-3';20第20引物对,用于检测27号染色体、第10485983位点,包括:上游引物5'-ATATGTTAGAAGTTACAAGACGTGTTCCTGATATC-3';下游引物5'-AAAATGTTTTGTCCCACTGGTGAGTGGAAGTCTTC-3';21第21引物对,用于检测27号染色体、第10624210位点,包括:上游引物5'-ACGTGAAGATCACAAGTTGAAGTACATTGGTTTTT-3';下游引物5'-TCTGTGTAGCCGTTCAGTTCACGTGACTACGTGTT-3';22第22引物对,用于检测27号染色体、第10921192位点,包括:上游引物5'-AAGTAGTGAGATATCGTTACTCAAGGACCGAGGTG-3';下游引物5'-AGACCCTCTAACAAAAGAACGGGAAAGAGGGGGTA-3';23第23引物对,用于检测27号染色体、第13879684位点,包括:上游引物5'-CTACACTCCCTTGTCGTACTACCTCGTCGAACATT-3';下游引物5'-AGTTTCCGTTCTAAAGGGACTGAAAGTCGTGGTTT-3';24第24引物对,用于检测27号染色体、第14590208位点,包括:上游引物5'-ATCTAATTAAAACGAATAAATTATAAATTTAAAGG-3';下游引物5'-CCCTTTTATAGATGACGTTATCATCTGTGAGTTGT-3';25第25引物对,用于检测27号染色体、第27180100位点,包括:上游引物5'-CATACACGATATCCTTTTCTCAAAAAGATCTCGAT-3';下游引物5'-CAAAAAGAAAACTACTGTGGGTTGTTTATACATAC-3';26第26引物对,用于检测32号染色体、第29019804位点,包括:上游引物5'-AAACTTTAGAAGAGTATTCGGTCTATAACTTCTTA-3';下游引物5'-ATCTCCTTCAGGGACAAGAATCGAATGTAGATTAA-3';27第27引物对,用于检测33号染色体、第16109127位点,包括:上游引物5'-AGAGTTCAACTACGAGTCCGACGGAACTGATTAGG-3';下游引物5'-AACAGGGACCTCTACTCGGGTAGAGTAAGAGTCCC-3';28第28引物对,用于检测34号染色体、第26112280位点,包括:上游引物5'-AAGGGTTTGTACTTTATGTGTGAGTTATACTATTC-3';下游引物5'-GGTTAGACTACAAGAGACAGACCGGTTACAATTTC-3';29第29引物对,用于检测34号染色体、第33905071位点,包括:上游引物5'-CGTTTATAAACTGGTTGGCCGGGAAGAAAACGGAG-3';下游引物5'-TCTCGTTAGTGAAGAGTGAGGAGTGATAACAATTT-3';30第30引物对,用于检测36号染色体、第4623473位点,包括:上游引物5'-TACTTTGATGTTCACCAGTTTCGTACCTCTCGAGG-3';下游引物5'-CGAAGAACAGGTGGTGGTAGATCGGATAAAGACCG-3'。

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