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一种交互式单细胞ATAC-seq数据分析系统及方法 

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申请/专利权人:成都信息工程大学;四川省计算机研究院

摘要:本发明公开了一种交互式单细胞ATAC‑seq数据分析系统及方法,本发明以scATAC‑seq特征峰的DNA序列作为数据集,利用基于scATAC‑seq特征峰的DNA序列作为数据集以此完成各个序列特征峰在各细胞中的染色质可及性、单细胞聚类、单细胞ATAC‑seq数据降噪、转录因子活性推断的任务。进一步地,本发明基于LoRA微调、Prefix微调与Adapter微调将预训练大模型适配到各个分析任务中,并以此搭建在线的交互式分析平台,有效降低了微调大型预训练模型的成本,使得生物信息学家可以轻松地进行单细胞ATAC‑seq数据分析,而无需掌握编程知识。

主权项:1.一种交互式单细胞ATAC-seq数据分析系统,其特征在于,包括:预训练模型,用于根据DNA序列预训练实现数据分析任务的单细胞ATAC-seq数据分析模型,并在完成预训练后嵌入到在线分析平台中;参数微调模块,嵌入在线分析平台中,用于根据数据分析任务对预训练后的单细胞ATAC-seq数据分析模型进行参数微调;在线分析平台,用于搭载单细胞ATAC-seq数据分析模型和参数微调模块,根据用户需求完成数据分析任务,并与用户交互。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 成都信息工程大学 四川省计算机研究院 一种交互式单细胞ATAC-seq数据分析系统及方法

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