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一种鉴定香菇品种的MNP标记法的开发及应用 

申请/专利权人:中国科学院微生物研究所;江汉大学

申请日:2022-05-16

公开(公告)日:2023-11-24

公开(公告)号:CN117106941A

主分类号:C12Q1/6895

分类号:C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/6806;C12Q1/6858

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2023.12.12#实质审查的生效;2023.11.24#公开

摘要:本发明公开了一种鉴定香菇品种的MNP标记法的开发及应用。本发明基于香菇187个菌株基因组重测序数据,筛选得到501个广泛MNP标记位点;通过相关引物设计和对78份香菇商业品种的多重扩增、MNP‑Seq测序,构建了香菇的MNP标记位点数据库。在此基础上进一步筛选187个具有100%检测率的MNP标记位点作为核心MNP标记位点,利用240个菌株的核心位点序列构建系统发育图谱,计算不同谱系间和品种间遗传相似度,据此判断两个品种为不同品种还是相同品种,为不同谱系还是相同谱系。本发明具有重要的应用价值。

主权项:1.引物组合甲,包括引物1—引物1002;所述引物1—引物1002的核苷酸序列依次如SEQIDNO:1-SEQIDNO:1002所示。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国科学院微生物研究所;江汉大学 一种鉴定香菇品种的MNP标记法的开发及应用

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