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一种基于自监督Graph-Transformer的多模态大脑网络重要区域识别方法 

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申请/专利权人:西北工业大学

摘要:本发明公开了一种基于自监督Graph‑Transformer的多模态大脑网络重要区域识别方法,首先将大脑的MRI数据构建成多模态脑图,将大脑的结构信息和功能信息分别映射为图的边特征和点特征;然后通过自监督模型GR‑GT,识别重要的脑图节点。GR‑GT采用编码器‑解码器的架构,将脑图作为输入并输出重构脑图,要求重构脑图尽可能接近原始脑图,并提取出所有的脑图节点对重构任务的贡献得分。具有高贡献得分的节点,说明对重构任务更重要,是本发明识别的大脑重要区域。本发明通过完全数据驱动的方式而非手工特征去分析数据,从而识别大脑网络的重要区域,有效避免了先验知识带来的固有限制。

主权项:1.一种基于自监督Graph-Transformer的多模态大脑网络重要区域识别方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤1:将大脑MRI数据构建成多模态脑图;将大脑定义为一个无向图G={V,E},V={vi|i∈1,2,…,N}表示图的节点集合,具有N个节点;表示图的节点特征;表示图的邻接矩阵;首先通过大脑分区模板将大脑表面划分为N个区域,作为图的节点;然后,使用功能MRI信号,计算节点之间的功能信号的皮尔逊相关系数得到功能相似矩阵,将其作为图的节点特征矩阵X,每个节点的特征向量长度D=N;最后,使用弥散张量成像DTI数据,计算节点之间的纤维连接得到结构连接矩阵,并通过稀疏化和二值化处理,得到图的邻接矩阵E;步骤2:通过自监督模型GR-GT模块得到大脑节点的贡献得分;在自监督模型GR-GT模块中,采用编码器-解码器结构实现图重构任务,并得到节点的贡献得分;首先将步骤1得到的脑图作为输入,利用编码器模块提取图的节点表示,然后利用掩码得分模块获取节点的贡献得分,最后利用解码器模块重构图的节点特征;编码器模块:将Transformer与图卷积GCN结合,首先采用Transformer层将自注意力机制应用于图的所有节点,然后使用GCN结合图的拓扑信息;过程如式1和式2所示:H'k+1=AttentionvHkQk,HkKk,HkVk1Hk+1=GCNE,H'k+12其中Hk为编码器模块中第k层的图节点表示,V为图的所有节点的集合,为投影矩阵,AttentionV表示对图的所有节点使用自注意力机制,E表示图的邻接矩阵;掩码得分模块:该模块位于编码器模块之后和解码器模块之前;编码器模块的输出是图的节点表示作为掩码得分模块的输入;经过多层感知机MLP和softmax后,Z被映射为p被视为图节点的贡献得分;然后按照比例k,对得分较低的节点进行屏蔽,并赋予掩码表示向量;最后,对图的节点表示和贡献得分进行哈达玛积运算,作为解码模块的输入;计算过程如式3所示: 其中softmax为非线性函数,rank表示排序函数,idx表示将p排序后数值高的索引,q表示屏蔽节点的掩码表示向量,cat表示按原顺序将节点表示与掩码表示向量拼接起来,⊙表示哈达玛积,Z′表示解码器模块的输入;解码器模块:解码器模块的输入是带有掩码信息的图节点表示,输出是重构出图的节点特征;解码器模块与编码器模块结构相同;GR-GT模块通过预测图的节点特征重建图;损失函数是重构图节点的特征矩阵Y与输入图节点的特征矩阵X之间的均方误差MSE;步骤3:将数据集通过步骤1和步骤2,得到重构图和节点的贡献得分,根据得分将大脑区域进行排名,按照设定比例,选取得分靠前的区域作为大脑重要区域。

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