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基于压缩状态的碱基调用 

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申请/专利权人:因美纳有限公司

摘要:所公开的技术包括一种系统。该系统包括:被配置为处理簇的测序图像并且产生空间卷积特征的空间卷积神经网络,被配置为从该空间卷积特征选择包含簇的中心的空间卷积特征子集的滤波逻辑,被配置为将该空间卷积特征子集压缩为压缩特征集合的压缩逻辑,被配置为访问该压缩特征集合中的压缩特征的状态信息的上下文化逻辑,被配置为处理有状态压缩特征集合并且产生时间卷积的有状态特征的时间卷积神经网络,以及被配置为基于该时间卷积的有状态特征而产生针对该簇的碱基调用的碱基调用逻辑。

主权项:1.一种系统,包括:空间卷积神经网络,所述空间卷积神经网络被配置为处理簇的测序图像并且产生空间卷积特征;滤波逻辑,所述滤波逻辑被配置为从所述空间卷积特征选择包含所述簇的中心的空间卷积特征子集;压缩逻辑,所述压缩逻辑被配置为将所述空间卷积特征子集压缩为压缩特征集合,其中所述空间卷积特征子集具有M个通道,并且所述压缩特征集合具有N个通道,并且其中MN;上下文化逻辑,所述上下文化逻辑被配置为访问所述压缩特征集合中的压缩特征的状态信息,并且将所述状态信息与所述压缩特征相加以生成有状态压缩特征集合;时间卷积神经网络,所述时间卷积神经网络被配置为处理所述有状态压缩特征集合,并且产生时间卷积的有状态特征;以及碱基调用逻辑,所述碱基调用逻辑被配置为基于所述时间卷积的有状态特征而生成针对所述簇的碱基调用。

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