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与鸡皮肤乌度相关的TYR基因分子标记及其应用 

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申请/专利权人:华南农业大学;清远市清城区清远鸡研究院;清远市清城区动物卫生防疫中心

摘要:本发明公开了与鸡皮肤乌度相关的TYR基因分子标记及其应用,属于家禽育种领域。本发明对五黑鸡的血液样本进行研究,发现TYR基因的第一外显子上存在两个与五黑鸡翅下胸部皮肤乌度显著关联的SNP位点,两个SNP位点分别为SNP1和SNP2,SNP1为如SEQIDNO:1所示序列存在NC_052532.1:g667TC,SNP2为如SEQIDNO:1所示序列存在NC_052532.1:g759TC。经试验发现,上述两个位点与五黑鸡皮肤乌度显著相关,可作为五黑鸡皮肤乌度选育的分子标记,辅助五黑鸡皮肤乌度性状的早期筛选,这对推进五黑鸡品种的选育和鸡皮肤乌度研究具有积极意义。

主权项:1.一种鉴别五黑鸡皮肤乌度的方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)以待测鸡基因组DNA为模板,利用引物扩增分子标记或者分子标记的基因片段,获取扩增产物;所述引物为如SEQIDNO:2所示的上游引物和SEQIDNO:3所示的下游引物;所述分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO:1所示,所述分子标记包括单核苷酸多态性位点SNP1和SNP2,其中,所述SNP1为SEQIDNO:1所示序列第667位存在TC,所述SNP2为如SEQIDNO:1所示序列第759位存在TC;(2)对所述扩增产物测序,检测SNP1和SNP2的基因型,根据检测的基因型判断待测鸡的皮肤乌度;所述SNP1和所述SNP2均存在TT、CT和CC三种基因型;所述鸡的皮肤乌度为鸡翅下胸部皮肤乌度,所述SNP1和所述SNP2两个位点处基因型为TT、CT和CC基因型时,都与鸡翅下胸部皮肤乌度显著相关;在所述SNP1位点处,TT基因型的鸡翅下胸部皮肤乌度高于CC基因型的鸡翅下胸部皮肤乌度,TT基因型和CT基因型的鸡翅下胸部皮肤乌度无显著差异,CT基因型和CC基因型的鸡翅下胸部皮肤乌度无显著差异;在所述SNP2位点处,TT基因型的鸡翅下胸部皮肤乌度高于CT基因型的鸡翅下胸部皮肤乌度,TT基因型和CC基因型的鸡翅下胸部皮肤乌度无显著差异,CT基因型和CC基因型的鸡翅下胸部皮肤乌度无显著差异。

全文数据:

权利要求:

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