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利用确定性限制位点全基因组扩增(DRS-WGA)分析至少两个样本的相似度的方法 

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申请/专利权人:美纳里尼硅生物系统股份公司

摘要:本申请涉及一种分析包含基因组DNA的多个样本中至少两个样本的相似度的方法。该方法包括以下步骤。a提供包含基因组DNA的多个样本。b对每个样本分别进行基因组DNA的确定性限制位点全基因组扩增DRS‑WGA。c使用无片段化、测序衔接子WGA融合引物PCR反应,由所述DRS‑WGA的每个产物制备大规模平行测序文库。d对所述大规模平行测序文库以小于1x的平均覆盖深度进行低通全基因组测序。e将步骤d中获得的每个样本的读数与参考基因组进行比对。f为每个样本提取多个多态性基因座上的等位基因含量。g根据在所述多个基因座处测得的等位基因含量,计算至少两个样本的成对相似度得分基因座。h根据相似度得分确定至少两个样本的相似度。

主权项:1.一种分析包含基因组DNA的多个样本中至少两个样本的相似度的方法,所述方法包括以下步骤:a提供包含基因组DNA的多个样本;b对每个样本分别进行所述基因组DNA的确定性限制位点全基因组扩增DRS-WGA;c使用无片段化、测序衔接子WGA融合引物PCR反应,由所述DRS-WGA的每个产物制备大规模平行测序文库;d对所述大规模平行测序文库以小于1x的平均覆盖深度进行低通全基因组测序;e将步骤d中获得的每个样本的读数与参考基因组进行比对;f为每个样本提取多个多态性基因座上的等位基因含量;g根据在所述多个基因座上测得的等位基因含量,计算至少两个样本的成对相似度得分;h根据相似度得分确定至少两个样本的相似度。

全文数据:

权利要求:

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