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胃肠间质瘤冷冻组织ATAC-seq测序文库的构建方法 

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申请/专利权人:四川大学华西医院

摘要:本发明涉及染色质转座酶可及性测序技术领域,具体公开了胃肠间质瘤冷冻组织ATAC‑seq测序文库的构建方法,通过先将胃肠间质瘤冷冻组织进行研磨组织,制备细胞悬液并提取细胞核,再将细胞核进行转座及纯化,获得纯化物,然后将纯化物进行PCR富集,并构建文库及片段筛选,获得筛选物,最后将筛选物进行文库质检,获得测库文库,通过此方式可以克服胃肠间质瘤冷冻组织在某些实验上的限制,并最终获得适用于后续研究的DNA文库和测库文库,这样可以更好地研究和理解胃肠间质瘤冷冻组织的特征和遗传信息,从而很好地解决现有ATAC‑seq技术对胃肠间质瘤冷冻组织并不适用的问题。

主权项:1.胃肠间质瘤冷冻组织ATAC-seq测序文库的构建方法,其特征在于:包括如下步骤:S1、将胃肠间质瘤冷冻组织进行研磨组织,制备细胞悬液并提取细胞核;所述胃肠间质瘤冷冻组织在进行研磨组织时,先将胃肠间质瘤冷冻组织放入盛有HBunstablebuffer的离心管中,并在冰上静置至少5分钟,用镊子夹住样品,并使用剪刀剪碎,再将样品转移至玻璃研磨器中,补充HBunstablebuffer,使用A研磨棒研磨组织进行研磨10-15次;S2、将细胞核进行转座及纯化,获得纯化物;S3、将纯化物进行PCR富集,并构建文库及片段筛选,获得筛选物;S4、将筛选物进行文库质检,获得测库文库。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 四川大学华西医院 胃肠间质瘤冷冻组织ATAC-seq测序文库的构建方法

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