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申请/专利权人：中国农业科学院农业基因组研究所
摘要：本发明提供了一种兼容宽范围ChIPDNA投入量的三维基因组检测方法，通过片段化酶的单次酶切反应可以将一定范围内不同投入量的ChIPDNA打断，再在打断的ChIPDNA末端连接测序接头，并通过生物素富集来捕获三维相互作用的ChIPDNA片段，再进行扩增、筛选，可获得良好的文库，可通过如高通量二代测序仪等测序分析获得三维基因组相互作用模式。由于单个样本的ChIPDNA产量通常在片段化酶兼容的投入量范围之内，该方法仅需单次酶切反应即可完成单个样本所有ChIPDNA的打断处理，降低酶切反应的次数和实验成本，数据质量优异。
主权项：1.一种兼容宽范围ChIPDNA投入量的三维基因组检测方法，该方法采用片段化酶对insituChIA-PET前期处理所获的ChIPDNA进行单次酶切反应，一次性完成单个样本所有ChIPDNA的打断处理，所述片段化酶为FEAEnzymeMix，所述片段化酶进行酶切反应的过程包括：25~37℃温度下反应2~30min，然后65~72℃温度下反应10~30分钟，最后在4~10℃温度下反应5~10分钟，片段化酶投入量为10μL，insituChIA-PET前期处理所获的ChIPDNA的投加量范围为1~100ng。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国农业科学院农业基因组研究所 一种兼容宽范围ChIP DNA投入量的三维基因组检测方法
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