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一种基于环境核酸的豚鲟类生物丰度评估方法 

申请/专利权人:中国环境科学研究院

申请日:2024-01-24

公开(公告)日:2024-06-04

公开(公告)号:CN118127170A

主分类号:C12Q1/6888

分类号:C12Q1/6888;C12Q1/686;C12Q1/6869;C12N15/11

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.06.21#实质审查的生效;2024.06.04#公开

摘要:本发明公开了一种基于环境核酸的豚鲟类生物丰度评估方法。属于生物丰度评估技术领域。包括以下步骤:生物组织DNA的提取;研究区域及样品采集;环境核酸样品提取;环境核酸样品PCR扩增;测序与数据分析;结果分析。本发明具有环境友好性,属于非破坏性采样,克服了传统方法对目标物种扰动严重的缺点;技术流程易于标准化,便于对比分析和研究,克服了传统观测方法肉眼观察的不确定性;方便快捷,实现“一杯水即可判断豚鲟大型生物丰度”的目的,克服了传统方法成本高、费时费力的缺点。

主权项:1.一种基于环境核酸的豚鲟类生物丰度评估方法,其特征在于,包括以下步骤:1生物组织DNA的提取;2研究区域及样品采集;3环境核酸样品提取;4环境核酸样品PCR扩增:根据设计的引物区域位置,计算出扩增产物的理论分子量,进行扩增;5将PCR扩增产物检测,验证;6测序与数据分析:将成功扩增的片段测序,对原始数据进行预处理,切除接头、引物,继而进行序列拼接;过滤、去冗余;以97%相似度进行聚类,获得生物OTU的数量和种类信息,或通过降噪获得ASV的数量和种类信息;7结果分析。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国环境科学研究院 一种基于环境核酸的豚鲟类生物丰度评估方法

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