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一种基于生成流网络的基因调控网络构建方法 

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申请/专利权人:北京工业大学

摘要:本发明公开了一种基于生成流网络的基因调控网络构建方法,包括以下步骤:在小鼠造血干细胞的sc‑RNA‑seq数据集上进行实验,评估构建基因调控网络的性能。利用稀疏Transformer对scRNA‑seq数据进行稀疏特征提取,以便于后续更准确地构建基因调控网络;在稀疏特征提取完之后,将稀疏特征输入生成流网络模型进行基因调控网络的构建。通过生成流网络模型的多次迭代更新,得到与小鼠造血干细胞sc‑RNA‑seq数据集相关联的基因调控关系的一个概率分布,通过设定调控提取阈值提取得到最终的基因调控网络。本发明有效缓解了现有方法难以从稀疏的scRNA‑seq数据捕获复杂的基因调控关系的问题,可以作为一个有效工具为医学研究者分析基因调控机理提供参考。

主权项:1.一种基于生成流网络的基因调控网络构建方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤一,数据获取:在小鼠造血干细胞的sc-RNA-seq数据集上进行实验,评估构建基因调控网络的性能;步骤二,稀疏特征提取:利用稀疏Transformer对scRNA-seq数据进行稀疏特征提取,以构建基因调控网络;步骤三,基因调控关系的构建:在稀疏特征提取完之后,将稀疏特征输入生成流网络模型进行基因调控网络的构建;步骤四,基因调控网络的融合与提取:通过生成流网络模型的多次迭代更新,得到与小鼠造血干细胞sc-RNA-seq数据集相关联的基因调控关系的一个概率分布,通过设定调控提取阈值提取得到最终的基因调控网络。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 北京工业大学 一种基于生成流网络的基因调控网络构建方法

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