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ddPCR定量检测2种急性淋巴细胞白血病融合基因的方法与试剂盒 

申请/专利权人:中南大学湘雅医院

申请日:2024-03-27

公开(公告)日:2024-06-25

公开(公告)号:CN118240938A

主分类号:C12Q1/6886

分类号:C12Q1/6886;C12Q1/686;C12N15/11

优先权:["20231218 CN 2023117399997"]

专利状态码:在审-公开

法律状态:2024.06.25#公开

摘要:一种ddPCR定量检测2种急性淋巴细胞白血病融合基因的方法与试剂盒,一种基于数字PCR定量检测急性淋巴细胞白血病相关融合基因表达的引物组合,其特征在于,包括:根据2种急性淋巴细胞白血病相关融合基因:TEL‑AML1和E2A‑PBX1的基因序列设计的多条特异性引物,以及根据正常的ABL1基因序列设计的内参引物。

主权项:1.一种基于数字PCR定量检测急性淋巴细胞白血病相关融合基因表达的引物组合,其特征在于,包括:根据2种急性淋巴细胞白血病相关融合基因:TEL-AML1和E2A-PBX1的基因序列设计的多条特异性引物,以及根据正常的ABL1基因序列设设计的内参引物;用于检测TEL-AML1融合基因的SeqIDNo.1-2所示核苷酸序列的引物和SeqIDNo.7所示核苷酸序列的探针;用于检测E2A-PBX1融合基因的SeqIDNo.3-4所示核苷酸序列的引物和SeqIDNo.8所示核苷酸序列的探针;用于检测ABL1基因内参的SeqIDNo.5-6所示核苷酸序列的引物和SeqIDNo.9所示核苷酸序列的探针;筛选扩增效率一致且阴性阳性微滴明显分离的引物,最终选定的检测用引物和探针序列如下: 序列号 序列名称 核酸序列5’-3’ SEQIDNO.1 TEL-AML1-F1 GTCTCTGTCTCCCCGCCTG SEQIDNO.2 TEL-AML1-R1 GGCGGCTCGTGCTGGCAT SEQIDNO.3 E2A-PBX1-F1 CACCAGCCTCATGCACAACC SEQIDNO.4 E2A-PBX1-R1 CTGGGCTCCTCGGATACTCAAAA SEQIDNO.5 ABL1-F1 GGGCGTGTGGAAGAAATA SEQIDNO.6 ABL1-R1 ACCAGGTTAGGGTGTTTGA SEQIDNO.7 TEL-AML1-P1 TCTCCCAATGGGCATGGCGTG SEQIDNO.8 E2A-PBX1-P1 CACCCTCCCTGACCTGTCTCGGC SEQIDNO.9 ABL1-P1 AGACCTTGAAGGAGGACACC 所述探针的5’端连接荧光报告基团,3’端淬灭基团连接;用于检测TEL-AML1融合基因的探针5’端标记为HEX荧光修饰,3’端标记为BHQ1淬灭修饰;用于检测E2A-PBX1融合基因的探针5’端标记为CY5荧光修饰,3’端标记为BHQ2淬灭修饰;用于检测ABL1基因内参的探针5’端标记为ROX荧光修饰,3’端标记为BHQ2淬灭修饰。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中南大学湘雅医院 ddPCR定量检测2种急性淋巴细胞白血病融合基因的方法与试剂盒

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