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申请/专利权人：西湖实验室(生命科学和生物医学浙江省实验室)
摘要：本申请提出了一种大规模化合物库的虚拟筛选方法及筛选装置，包括以下步骤：获取代表训练集以及获取分子生成模型生成的多个第一对接分子；设定靶点蛋白，计算每一第一对接分子与所述靶点蛋白的对接得分，将每一第一对接分子与对应的对接得分结合得到对接得分训练集，对接得分训练集用于对对接得分预测架构进行训练得到训练好的对接得分预测模型；并行获取多个优化分子生成模型生成的优化对接分子集合，自优化对接分子集合中选取靶点特异性得分高的多个优化对接分子作为初步虚拟筛选结果，将所述初步虚拟筛选结果与所述第一对接分子进行合并得到最终虚拟筛选结果。本方案使用类药数据库选择超大化合物库代表性训练集从而可以使用较少的计算资源进行大规模化合物库的虚拟筛选。
主权项：1.一种大规模化合物库的虚拟筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：获取代表训练集，所述代表训练集中包括至少一类药小分子；获取分子生成模型生成的多个第一对接分子，其中所述分子生成模型利用所述代表训练集对分子生成架构进行训练得到；设定靶点蛋白，计算每一第一对接分子与所述靶点蛋白的对接得分，将每一第一对接分子与对应的对接得分结合得到对接得分训练集，其中对接得分训练集用于对对接得分预测架构进行训练得到训练好的对接得分预测模型，每一对接分子以分子图形式表示；并行获取多个优化分子生成模型生成的优化对接分子集合，其中优化分子生成模型由对接得分预测模型引入分子生成模型的损失函数中强化迭代学习得到，每次迭代学习得到多个优化对接分子，并保存每轮迭代得到的所有优化对接分子得到优化对接分子集合；自优化对接分子集合中选取靶点特异性得分高的多个优化对接分子作为初步虚拟筛选结果，将所述初步虚拟筛选结果与所述第一对接分子进行合并得到最终虚拟筛选结果。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 西湖实验室(生命科学和生物医学浙江省实验室) 一种大规模化合物库的虚拟筛选方法及筛选装置
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