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构建染色体的方法和装置及其应用 

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申请/专利权人:安诺优达基因科技(北京)有限公司

摘要:本发明公开了一种构建染色体的方法和装置及其应用。该方法包括:将同源四倍体样本的四组基因组进行染色体构建,同源四倍体样本的四组基因组通过同源四倍体基因组的分型组装方法获得。本发明的方法和装置具有良好的分型组装效果,可以应用于高度同源的同源四倍体样本,而且花费较低,取样容易。

主权项:1.一种构建染色体的方法,其特征在于,所述方法包括:将同源四倍体样本的四组基因组进行染色体构建,所述同源四倍体样本的四组基因组通过同源四倍体基因组的分型组装方法获得,所述同源四倍体基因组的分型组装方法包括:步骤1、将同源四倍体基因组样本的测序数据集与所述样本的近缘二倍体物种的分型后的参考基因组分别进行比对;根据比对结果鉴定基因组变异信息并分型,得到能分型的且与参考基因组相似的测序数据集I、能分型的且与参考基因组不相似的测序数据集II,以及无法分型的测序数据集III;步骤2、将所述样本的测序数据集与所述参考基因组中的任意一组进行比对,获得单碱基深度,提取单碱基深度≥12平均深度的测序数据集IV;步骤3、将所述测序数据集I与所述测序数据集III合并组装,得到同源四倍体基因组的第一基因组、第二基因组;将测序数据集II与所述测序数据集III、测序数据集IV合并组装,得到同源四倍体基因组的第三基因组、第四基因组。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 安诺优达基因科技(北京)有限公司 构建染色体的方法和装置及其应用

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