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一种基于模态转换的CBCT生成Micro-CT方法 

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申请/专利权人:同济大学

摘要:本发明涉及计算机医学图像处理领域,提出了一种基于模态转换的CBCT生成Micro‑CT方法,包括步骤:数据预处理;通过定义变分距离,完成对CBCT和Micro‑CT之间转化的建模;转化为神经网络优化问题,推导损失函数Loss;设计一种端到端神经网络‑变分神经网络Vsnet;训练神经网络;用神经网络进行CBCT到Micro‑CT的转化。本发明易于实现,可以从低分辨率,边界模糊的CBCT图像生成清晰的Micro‑CT图像;可以在不需要离体牙的前提下,得到患者口中的Micro‑CT图像;同时经过验证,有较高的准确度。

主权项:1.一种基于模态转换的CBCT生成Micro-CT方法,其特征在于,把模态转化问题转化为一个神经网络优化问题,通过建模,推导出一个损失函数,并根据这个损失函数设计神经网络,训练该网络,然后实现对待转化数据的转化;包括如下步骤:步骤1:数据预处理;步骤2:通过定义变分距离,完成对CBCT和Micro-CT之间转化的建模;步骤3:根据步骤2得到变分距离和模型,把变分推断转化为神经网络优化问题,推导损失函数Loss;步骤4:根据步骤3得到的损失函数表达式,设计一种端到端神经网络变分神经网络Vsnet,并对神经网络进行训练;步骤5:使用步骤4训练后的神经网络进行CBCT到Micro-CT的转化;所述步骤2,定义变分距离,完成对CBCT和Micro-CT转化的建模,具体实施过程:2.1定义据集D=yj,xj|j=0,1,2…n},其中yj和xj分别代表第j个CBCT图像和Micro-CT图像;yj,xj写成向量形式为yj=[y1,y2,…,yd]T∈Rd,xj=[x1,x2,…,xd]T∈Rd,其中d的值为图像的宽度*高度,R代表实数域,yi和xi分别代表yj,xj展开后向量的一个值,代表图像的一个像素;2.2根据步骤2.1的定义表示,定义变分距离为rj=[r1,r2,…,rd]T∈Rd来表示CBCT和Micro-CT的不同,其中ri是rj展开后向量的一个元素,表示为一个均值为Ci,方差为δi的高斯分布Ci是一个常数,衡量的是机器之间的差别,是一个不变的值;δi代表ri和标准模态距离Ci的微小偏差,是一个很小的值;2.3根据步骤2.1的定义表示,定义zj=[z1,z2,…,zd]T∈Rd来表示生成的Micro-CT的值和标签图像的不同,zi是zj展开后向量的一个元素,表示为一个均值为xi,方差为εi的高斯分布其中zi是生成的Micro-CT结果,xi是给定Micro-CT数据,εi代表生成的Micro-CT和给定Micro-CT之间的差距;2.4根据步骤2.2和步骤2.3的定义,定义CBCT图像的一个像素,yi表示为一个均值为zi+ri,方差为σi的高斯分布2.5根据步骤2.4定义的高斯分布中的方差σ服从逆伽马分布其中αi,βi是逆伽马分布的参数;2.6根据步骤2.4定义的高斯分布,定义变分推断近似分布qz+r,σ2|y来估计先验分布pz+r,σ2|y;qz+r,σ2|y表达式由qz|y,qr|y,qσ2|y三部分组成,分别用下面的公式a,b,c表示;公式a中μi,分别是qzi|y的均值和方差,公式b中的λi,是qri|y的均值和方差,公式c中的αi,βi是作为逆伽马分布的两个参数; 至此,完成了基本的数据建模,并把要需要估计的变分形式qz|y,qr|y,qσ2|y用具体的表达式表示;所述步骤3,根据步骤2得到变分距离和模型,把变分推断转化为神经网络优化问题,推导损失函数Loss;具体步骤为:3.1根据贝叶斯框架,CBCT图像的边缘似然被建模为 把公式1中的展开,写成具体的形式: 3.2步骤3.1的公式1中,logpy;z+r,σ2被DKLqz+r,σ2;y||pz+r,σ2;y约束;因为先验的不可知和KL散度的非负性,公式1中的DKL无法求解;模态转化问题转化为最大化置信下界3.3在步骤3.2把模态转化问题转化为最大化置信下界后,又增加了约束DKLqr|y||pr来起到更好的估计qz|y和qr|y的效果,模态转化问题转化为希望能够最小化: 公式3就是要优化的损失函数;3.4把公式3中的DKLqrj|yj||prj部分写为具体可计算形式,得到公式4: 3.5为了计算步骤3.3得到的置信下界ELBO把公式2中的logpz+r,σ2和DKLqz+r;y||pz+r表示为可计算的形式,公式5是把logpz+r,σ2写为可计算形式,公式6是把DKLqz+r;y||pz+r写为可计算形式: 3.6组合公式3,公式4,公式5,公式6,把损失函数写成可计算的形式,得到公式7: 至此,得到了最终的损失函数表达式;所述步骤4,根据步骤3得到的输入计算机能直接计算利用的损失函数表达式,设计一种新的端到端神经网络-变分神经网络Vsnet;并对神经网络Vsnet进行训练,具体步骤为:4.1以步骤3推导的结果公式7作为损失函数,来设计一个端到端神经网络-变分神经网络Vsnet,该Vsnet网络包括Unet、DNN两部分,其中,Unet部分用来预测高斯分布的参数μi,λi,其中DNN部分辅助Unet训练,用来预测逆伽马分布的参数αi,βi;4.2把预处理好的CBCT图像作为步骤4.1Vsnet网络的输入,把预处理好的Micro-CT作为网络训练的标签,以步骤3得到公式7是Vsnet网络的损失函数;训练过程中,训练数据通过Vsnet中的Unet部分,得到高斯分布的参数μi,λi,通过Vsnet中的DNN网络部分得到逆伽马分布的参数αi,βi;把Vsnet神经网络的输出μi,λi,αi,βi用损失函数即公式7计算,得到Vsnet神经网络的计算结果和真实结果的差距,并反向传播损失,以修正神经网络的参数,直到损失达到了阈值效果则停止迭代;至此,训练好一个更够完成CBCT到Micro-CT转化的神经网络;所述步骤5,使用步骤4训练的神经网络进行CBCT到Micro-CT的转化,具体步骤为:5.1对一个待预测的CBCT数据,把CBCT数据送入Unet神经网络,该Unet网络输出的四通道内容分别是μi,λi,取其中输出的μi作为转换的结果,输出的μi是qzi|y的均值,也就是生成的Micro-CT图像;5.2把输出的μi转换结果,进行逆归一化,转化为Micro-CT图像的格式,得到最终的转换结果。

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