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申请/专利权人：中国水产科学研究院南海水产研究所
摘要：本发明公开了一种卵形鲳鲹脂肪酸性状相关基因的筛选方法，该方法基于核苷酸多样性π和遗传分化指数Fst的选择信号分析策略共同鉴定出与卵形鲳鲹脂肪酸性状相关的候选基因，本发明采用全基因组选择性扫描分析研究了卵形鲳鲹鱼脂肪酸性状的遗传基础，筛选到了与卵形鲳鲹鱼脂肪酸性状相关的候选基因，这些功能基因的定位对加速卵形鲳鲹新品种育种进程、提高育种效率具有重要意义。
主权项：1.一种卵形鲳鲹脂肪酸性状相关基因的筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：1从不同养殖群体中分别挑选卵形鲳鲹样本，对每尾卵形鲳鲹建立样本信息，并采集鱼体背部背鳍下方皮下白色肌肉保存备用，同时采集鱼的鳍条组织保存备用；2对步骤1中的肌肉样本进行粗脂肪含量和脂肪酸含量的测定；3对步骤2获得的粗脂肪含量和脂肪酸含量数据进行群体间方差分析与多重比较，筛选出脂肪酸含量差异最大的两个卵形鲳鲹群体；4将步骤3筛选到的两个卵形鲳鲹群体的鳍条样本进行DNA提取，随后进行全基因组重测序，并对rawdata进行质量控制和过滤；5将步骤4过滤后的重测序数据与卵形鲳鲹参考基因组进行比对及变异检测，获得SNP数据信息；6基于核苷酸多样性πratio和遗传分化指数Fst，将步骤5获得的SNP数据信息进行选择信号分析，获得卵形鲳鲹选择信号区域；7将步骤6获得的选择信号区域与卵形鲳鲹参考基因组注释文件进行比对，获得候选基因；8对步骤7获得的候选基因进行功能富集分析，结合卵形鲳鲹脂肪酸性状，获得这两个差异群体脂肪酸性状相关的基因。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国水产科学研究院南海水产研究所 一种卵形鲳鲹脂肪酸性状相关基因的筛选方法及其应用
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