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申请/专利权人：徐州医科大学
摘要：本申请涉及生物信息学领域，具体涉及一种基于TRIM35和STING的计算机辅助药物筛选方法、系统及设备。包括获取STING蛋白、TRIM35蛋白数据；选取所述STING蛋白、TRIM35蛋白复合物的空间结构，确定复合物结合位点作为靶向药物的结合位点；采用计算机辅助筛选药物的方法得到靶向所述结合位点的候选药物。本申请通过计算机虚拟筛选药物，极大地缩短研究周期，节约研究经费，提高研究效率，对于涉及的疾病防治研究具有重要的研究意义。
主权项：1.一种基于TRIM35和STING的计算机辅助药物筛选方法，其特征在于，所述方法具体包括：获取STING蛋白、TRIM35蛋白数据；选取所述STING蛋白、TRIM35蛋白复合物的空间结构，确定复合物结合位点作为靶向药物的结合位点；所述确定复合物结合位点的方法包括：构建TRIM35的n种截短表达突变体，n为大于等于1的自然数；基于所述n种截短表达突变体进行免疫共沉淀实验得到TRIM35的C端区域SPRY是与STING相互作用的关键区域；所述TRIM35的C端区域SPRY与所述STING的跨膜结构域相互作用为复合物结合位点；采用计算机辅助筛选药物的方法得到靶向所述结合位点的候选药物；所述计算机辅助筛选药物的方法过程为：获取STING蛋白与TRIM35蛋白复合物结合位点；基于所述STING蛋白与TRIM35蛋白复合物结合位点的空间结构在分子数据库中筛选结构相似的小分子化合物；对筛选得到的小分子化合物与STING蛋白进行分子对接计算靶向受体的亲和性结合能得到得分，根据所述得分进行排序得到候选药物；或计算机辅助筛选药物的方法过程替换为：计算机辅助筛选药物基于STING蛋白与TRIM35蛋白复合的活性位点筛选蛋白类似物抗体RNA药物；或者筛选与TRIM35相似的蛋白抗体RNA药物，得到候选药物；或计算机辅助筛选药物的方法过程替换为：计算机辅助筛选药物基于STING蛋白与TRIM35蛋白复合的活性位点或作用靶点筛选小分子抑制剂或抗体，得到候选药物。
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权利要求：
百度查询： 徐州医科大学 一种基于TRIM35和STING的计算机辅助药物筛选方法、系统及设备
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