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一种临床隐球菌高致病力相关的lncRNA检测方法和应用 

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申请/专利权人:东北大学

摘要:本发明公开了一种地域性临床隐球菌特异性遗传性状lncRNA的检测和应用,所属分子生物学技术领域。发明人通过收集全国重要省市收集临床分离株、环境分离株进行全基因组测序,进一步运用GWAS,配合多元线性回归、逻辑回归等将基因与表型进行关联性分析,挖掘与地域菌株高度相关的核酸序列特征,筛选得到地域遗传性状534个,新型毒力因子126个,包括23个长链非编码RNA。通过进一步的筛选得到1个lncRNA的突变位点与临床隐球菌高致病力性状相关,该突变位点位于如SEQIDNO.1所示的隐球菌lncRNA基因的第214位碱基上,该位点为CT单碱基突变。该位点的突变与高致病力性状的隐球菌紧密相关,采用简便的基因分型技术检测该位点,便可在早期精准诊断患者携带的隐球菌是否是高致病力菌株,明确临床用药量,灵敏性好,特异度高,应用前景广阔,具有重要价值。

主权项:1.检测SEQIDNO.1所示基因突变的试剂在制备鉴定临床隐球菌致病力的产品中的应用。

全文数据:

权利要求:

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