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一种检测小肠结肠炎耶尔森菌的系统、方法及其应用 

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申请/专利权人:上海旺旺食品集团有限公司;上海市生物医药技术研究院

摘要:本发明公开了一种检测小肠结肠炎耶尔森菌的系统、方法及其应用。所述方法包括:识别小肠结肠炎耶尔森菌基因组序列中富含AT碱基的序列作为目标序列;针对目标序列自动化、高通量地设计特异性引物;设计特定的Tm值计算公式计算反应变性及退火温度,并据此设置核酸扩增反应条件;在模板局部解链的条件下进行核酸扩增反应。本发明靶向传统核酸扩增方法通常需要规避的富含AT碱基的序列,极大地拓宽候选靶标区域;通过基于海量基因组数据的特异性排查,以及针对富含AT区域的Tm值的精确计算,实现双链DNA的局部解链,大大降低了核酸扩增技术中非特异性扩增的可能性。该方法有效地拓展了传统核酸扩增技术的应用范围,显著提升了反应性能。

主权项:1.一种引物对,其特征在于,所述引物对为:引物对G:Yer-F1:5’-ATGGAAAATAACATAATTTCTATTACCGG-3’SEQIDNO.1Yer-R1:5’-TCTCTGCGAATAACCTTGTG-3’SEQIDNO.2;引物对D:Yer-F2:5’-TGTGCGGTGGATGTAAATAATTC-3’SEQIDNO.3Yer-R2:5’-GCTTTGAAACTCAAGGACTG-3’SEQIDNO.4。

全文数据:

权利要求:

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