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唾液斑中微生物群落结构变化在预测唾液斑迹残留时间中的应用 

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申请/专利权人:公安部物证鉴定中心

摘要:本发明公开了唾液斑中微生物群落结构变化在预测唾液斑迹残留时间中的应用。本发明提供了检测唾液斑迹中微生物群落结构的物质在预测唾液斑迹残留时间中的应用。或本发明提供了检测唾液斑迹中微生物群落结构的物质在制备预测唾液斑迹残留时间产品中的应用。本发明应用16S扩增子测序技术,刻画了唾液斑迹中微生物群落结构随残留时间变化规律,并应用机器学习随机森林模型建立唾液斑迹残留时间预测方法,为案件快速侦办、深度发掘涉案生物物证信息、提升证据价值、提升法医DNA办案能力提供理论依据和技术支撑。

主权项:1.一种预测案件现场唾液斑迹残留时间的方法,包括如下步骤:A1建立训练集和检测案件现场唾液斑的微生物群落结构;所述建立训练集的方法包括如下步骤:A1-1、收集案件现场周围健康人的唾液样本,再将所有所述健康人唾液样本保存;提取不同保存时间的各个健康人的唾液样本中微生物的基因组DNA,扩增16sDNA,测序,得到16sDNA测序结果;所述保存时间小于等于150天;所述保存为在实验室室内环境条件下保存;所述实验室室内环境条件如下:室温为19-28℃、室内湿度为20-63%;A1-2、对A1-1得到的所述16sDNA测序结果注释,得到不同保存时间的唾液样本中微生物群落结构;将所述唾液样本的不同保存时间和不同保存时间下对应的微生物群落状态构成训练集;所述检测案件现场唾液斑的微生物群落结构的方法包括如下步骤:A1-3、提取所述案件现场唾液斑中微生物的基因组DNA,扩增16sDNA,测序,得到16sDNA测序结果;A1-4、再对A1-3得到的所述16sDNA测序结果注释,得到案件现场唾液斑中微生物群落结构;A2采用随机森林法对所述训练集进行计算,获得重要变量;A3将所述案件现场唾液斑中微生物群落结构通过随机森林法,以所述A2获得的重要变量为依据,与所述训练集比对,获得待测唾液斑迹的遗留时间;所述随机森林法的模型参数为:mtry=230,ntree=100;所述随机森林法的模型采用的样本分组为:0-14天、21-60天、90-150天;所述A2中采用随机森林法对所述训练集进行计算,获得重要变量为230个微生物属,所述230个微生物属为: 所述注释采用的软件为Uparse、MUSCLE、Qiime软件和R软件,所述比对的数据库为SILVA的SSUrRNA数据库。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 公安部物证鉴定中心 唾液斑中微生物群落结构变化在预测唾液斑迹残留时间中的应用

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