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一种实验动物淋巴结窦内红细胞识别与评估方法 

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申请/专利权人:成都华西海圻医药科技有限公司

摘要:一种实验动物淋巴结窦内红细胞识别与评估方法,涉及图像处理领域,其步骤为:扫描淋巴结染色切片;识别出需要的淋巴结组织并将其转换为第一感兴趣区域ROI1;在ROI1上设定伊红染色特征阈值小于预设值N1,设定红‑蓝比大于预设值N2,识别出淋巴结窦内红细胞并做出对应标记,再统计出各淋巴结窦内红细胞的面积,最后根据各淋巴结窦内红细胞的面积转换为各淋巴结窦内红细胞的评分。本发明能实现实验动物淋巴结窦内红细胞识别与评估人工智能化,实现快速准确的批量操作,解决实验动物中淋巴结窦内红细胞病变诊断漂移问题。

主权项:1.一种实验动物淋巴结窦内红细胞识别与评估方法,其特征在于,包括下述步骤:S1、切片扫描:使用数字切片扫描仪扫描实验动物的淋巴结HE染色切片;S2、淋巴结组织识别:在所述染色切片上识别出需要的淋巴结组织并将其转换为第一感兴趣区域ROI1;S3、淋巴结窦内红细胞识别及评估:在所述第一感兴趣区域ROI1上,设定伊红染色特征阈值小于预设值N1,设定红-蓝比大于预设值N2,识别出淋巴结窦内红细胞并做出对应标记,再统计出各淋巴结窦内红细胞的面积,最后根据各淋巴结窦内红细胞的面积转换为各淋巴结窦内红细胞的评分;所述步骤S2淋巴结组织识别的具体步骤为:S2.1、选定一定数量的淋巴结HE染色切片作为训练集,在训练集的染色切片上画出感兴趣区域,包含淋巴结组织区域与非淋巴结区域,将感兴趣区域内所有淋巴结组织区域做出对应标记,将非淋巴结区域标记为背景,之后应用深度学习U-Net模型即DeepLearning-U-Net模型进行训练,并在训练中对其进行调整,直至淋巴结组织识别准确率达到90%以上;S2.2、将需正式进行淋巴结组织识别的染色切片导入完成如步骤S2.1中所述模型训练的软件中,画出初始感兴趣区域ROI0,并在初始感兴趣区域ROI0内进行淋巴结组织识别,识别出的淋巴结组织区域自动做出对应标记,非淋巴结区域自动标记为背景;S2.3、再进行后处理,所述后处理步骤包括:S2.3.1、将淋巴结组织内的空白区域填充完整;S2.3.2、将面积小于预设值S1的淋巴结组织替换为背景;S2.3.3、将背景清除,使染色切片只保留淋巴结组织;S2.3.4、将保留的淋巴结组织转换为第一感兴趣区域ROI1。

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