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申请/专利权人:中科云谱(内蒙古)基因生物科技有限公司
摘要:本发明公开了一种基于大数据的绒山羊基因分析方法及系统,涉及生物信息学和生态保护技术领域,该发明通过全基因组测序技术,全面获取绒山羊的基因信息,避免了传统小规模样本采集的局限性。对绒山羊的历史健康信息进行系统收集,使得健康数据更加完整和精确。通过大数据技术,去除基因数据中的噪声和错误序列;通过构建综合数据库,将环境、基因和健康数据进行相关联整合,建立预测基因多样化分析模型。能够全面评估绒山羊群体的香农多样性指数Xnd、平均杂合指数Zhz、环境优渥指数Hjsy、遗传分化指数Ycf和绒山羊生理指数Slzs。相比传统单一维度的分析方法,本发明能够多维度综合考虑各种因素对绒山羊群体的影响,评估结果更加全面和科学。
主权项:1.一种基于大数据的绒山羊基因分析方法,其特征在于:包括,步骤一、通过大数据确定不同环境绒山羊栖息地的位置:利用卫星影像和无人机识别不同环境的绒山羊的栖息区域,并使用地理信息系统GIS,建立生态位模型;模拟绒山羊的分布范围,以划分为若干组栖息子区域,并做标记;步骤二、数据采集:在若干组栖息子区域内设置监测点,实时采集环境数据,包括气候、海拔、植被信息和水源信息,生成第一数据组;同时对若干组栖息子区域内绒山羊的基因样本进行采集,通过全基因组测序技术,对样本进行测序获取基因信息,生成第二数据组;同时收集若干组栖息子区域绒山羊的历史健康信息,生成第三数据组;步骤三、数据处理:去除第二数据组基因数据中的噪声和错误序列,对第一数据组和第三数据组进行清洗和标准化;步骤四、基因多样化预测分析:将第一数据组、第二数据组和第三数据组进行相关联整合,构建综合数据库,并建立预测基因多样化分析模型,将综合数据库作为输入项对若干组栖息子区域进行计算分析获得:香农多样性指数Xnd、平均杂合指数Zhz、环境优渥指数Hjsy、遗传分化指数Ycf和绒山羊生理指数Slzs;步骤五、群体多样性评估:将香农多样性指数Xnd和平均杂合指数Zhz相关联,获得第一评估指数dy1,若第一评估指数dy1低于第一多样性阈值,则生成第一策略,包括基因保护和基因交换策略;步骤六、多级预测分析:并对环境优渥指数Hjsy、遗传分化指数Ycf和绒山羊生理指数Slzs进行评估,获取相对应的评估结果,并根据相对应的评估结果,生成相对应策略。
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