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申请/专利权人：四川农业大学
摘要：本发明公开了一种黄嘌呤氧化酶抑制肽的虚拟筛选方法，属于生物活性肽筛选技术领域。在虚拟筛选初步阶段，使用了6种酶的41种组合，从猪源内脏蛋白中释放了两百多万条肽段，活性概率预测工具最终保留了14544种肽段，其中长度3‑6个氨基酸残基的肽段具有占比丰富和活性潜能更高的优势而被保留。将虚拟筛选保留的四种长度肽段与黄嘌呤氧化酶进行分子对接得到对接结合能，组成数据库，抑制活性具有正态分布，不存在间隙；建立预测模型时采用了32种氨基酸描述符对每种长度的黄嘌呤氧化酶抑制肽进行结构表征，使用6种机器学习方法进行建模，得到最佳模型，以最佳模型对黄嘌呤氧化酶抑制肽进行预测，得到高活性的黄嘌呤氧化酶抑制肽。
主权项：1.一种黄嘌呤氧化酶抑制肽的虚拟筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：1活性肽段筛选：选取可用于食品工业的酶对猪源内脏蛋白进行虚拟酶解，将所有酶解肽段保留，评估具有生物活性的酶解肽段并保留，得活性肽段；2分子对接：利用对接软件将步骤1筛选的活性肽段与黄嘌呤氧化酶进行对接，并统计对接结合能，同时合成具有不同对接结合能的活性肽段并测定其黄嘌呤氧化酶抑制活性IC50；3构建活性肽数据库：建立分子对接结合能与IC50的线性关系，通过线性方程得到其他结合能的体外黄嘌呤氧化酶抑制活性，从而构建了黄嘌呤氧化酶活性肽数据库；4建立预测模型：收集氨基酸描述符建立肽的结构特征变量矩阵，然后采用机器学习方法进行统计回归建模；5泛化测试：通过预测模型对黄嘌呤氧化酶抑制肽活性进行预测，得目的黄嘌呤氧化酶抑制肽。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 四川农业大学 一种黄嘌呤氧化酶抑制肽的虚拟筛选方法
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