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申请/专利权人:武汉明德生物科技股份有限公司
摘要:本发明公开了一种基于三代靶向测序检测RNA病毒的组合物、试剂盒及其应用,属于生物检测技术领域。本发明中的检测包括如下步骤:S1、提取RNA病毒核酸后,进行逆转录,得到cDNA;S2、使用上述组合物对cDNA进行扩增,得到扩增产物,扩增产物经处理后,建库,得到混合文库;S3、将混合文库中的扩增产物连接接头序列,得到待测样品;S4、对待测样品进行测序,并分析检测结果。本发明能同时扩增75种病原微生物,然后采用三代靶向测序,能快速准确地对上述75种病原微生物进行区分鉴定。
主权项:1.一种基于三代靶向测序检测RNA病毒的组合物,其特征在于,包括如下所示引物组中的至少2种组合:如SEQIDNO:1~6所示的扩增风疹病毒的引物组;如SEQIDNO:7~12所示的扩增登革热病毒2型的引物组;如SEQIDNO:13~18所示的扩增登革热病毒3型的引物组;如SEQIDNO:19~24所示的扩增柯萨奇病毒B6型的引物组;如SEQIDNO:25~30所示的扩增人类嗜T细胞病毒I型的引物组;如SEQIDNO:31~38所示的扩增柯萨奇病毒B2型的引物组;如SEQIDNO:39~44所示的扩增蜱传脑炎病毒的引物组;如SEQIDNO:45~48所示的扩增黄热病毒的引物组;如SEQIDNO:49~54所示的扩增柯萨奇病毒B5型的引物组;如SEQIDNO:55~60所示的扩增人类冠状病毒229E的引物组;如SEQIDNO:61~68所示的扩增戊型肝炎病毒的引物组;如SEQIDNO:69~74所示的扩增新疆出血热病毒的引物组;如SEQIDNO:75~80所示的扩增SARS病毒的引物组;如SEQIDNO:81~90所示的扩增萨比亚病毒的引物组;如SEQIDNO:91~96所示的扩增人类冠状病毒OC43的引物组;如SEQIDNO:97~102所示的扩增柯萨奇病毒A2型的引物组;如SEQIDNO:103~110所示的扩增柯萨奇病毒A9型的引物组;如SEQIDNO:111~116所示的扩增肠道病毒D70型的引物组;如SEQIDNO:117~120所示的扩增丙型流感病毒的引物组;如SEQIDNO:121~130所示的扩增裂谷热病毒的引物组;如SEQIDNO:131~138所示的扩增人鼻病毒A的引物组;如SEQIDNO:139~148所示的扩增人副肠孤病毒1型的引物组;如SEQIDNO:149~156所示的扩增柯萨奇病毒A16型的引物组;如SEQIDNO:157~168所示的扩增人副流感病毒4b型的引物组;如SEQIDNO:169~176所示的扩增人星状病毒的引物组;如SEQIDNO:177~184所示的扩增鹅口疮冠状病毒HKU12的引物组;如SEQIDNO:185~190所示的扩增穆尼亚冠状病毒HKU13的引物组;如SEQIDNO:191~198所示的扩增人副肠孤病毒3型的引物组;如SEQIDNO:199~206所示的扩增肠道病毒A71型的引物组;如SEQIDNO:207~214所示的扩增人类偏肺病毒的引物组;如SEQIDNO:215~222所示的扩增柯萨奇病毒A6型的引物组;如SEQIDNO:223~232所示的扩增人免疫缺陷病毒的引物组;如SEQIDNO:233~248所示的扩增甲型流感病毒H7N9的引物组;如SEQIDNO:249~258所示的扩增埃博拉病毒的引物组;如SEQIDNO:259~268所示的扩增肠道病毒D68型的引物组;如SEQIDNO:269~278所示的扩增新型布尼亚病毒的引物组;如SEQIDNO:279~288所示的扩增人呼吸道合胞病毒B型的引物组;如SEQIDNO:289~296所示的扩增丙型肝炎病毒1b亚型的引物组;如SEQIDNO:297~302所示的扩增乙型脑炎病毒的引物组;如SEQIDNO:303~312所示的扩增人类嗜T细胞病毒II型的引物组;如SEQIDNO:313~320所示的扩增甲型肝炎病毒的引物组;如SEQIDNO:321~328所示的扩增柯萨奇病毒B3型的引物组;如SEQIDNO:329~334所示的扩增人呼吸道合胞病毒A型的引物组;如SEQIDNO:335~342所示的扩增人轮状病毒A的引物组;如SEQIDNO:343~348所示的扩增登革热病毒1型的引物组;如SEQIDNO:349~360所示的扩增人鼻病毒B的引物组;如SEQIDNO:361~370所示的扩增麻疹病毒的引物组;如SEQIDNO:371~378所示的扩增狂犬病病毒的引物组;如SEQIDNO:379~388所示的扩增人副流感病毒3型的引物组;如SEQIDNO:389~400所示的扩增甲型流感病毒H1N1的引物组;如SEQIDNO:401~406所示的扩增腮腺炎病毒的引物组;如SEQIDNO:407~412所示的扩增乙型流感病毒的引物组;如SEQIDNO:413~420所示的扩增登革热病毒4型的引物组;如SEQIDNO:421~430所示的扩增人副流感病毒2型的引物组;如SEQIDNO:431~440所示的扩增人副流感病毒1型的引物组;如SEQIDNO:441~456所示的扩增东方马脑炎病毒的引物组;如SEQIDNO:457~466所示的扩增版纳病毒的引物组;如SEQIDNO:467~476所示的扩增淋巴脉络丛脑膜炎病毒的引物组;如SEQIDNO:477~482所示的扩增汉坦病毒的引物组;如SEQIDNO:483~490所示的扩增人类冠状病毒NL63的引物组;如SEQIDNO:491~500所示的扩增甲型流感病毒H5N1的引物组;如SEQIDNO:501~510所示的扩增甲型流感病毒H3N2的引物组;如SEQIDNO:511~518所示的扩增人鼻病毒C的引物组;如SEQIDNO:519~524所示的扩增寨卡病毒的引物组;如SEQIDNO:525~532所示的扩增肠道病毒A114的引物组;如SEQIDNO:533~540所示的扩增柯萨奇病毒B3型的引物组;如SEQIDNO:541~548所示的扩增诺如病毒的引物组;如SEQIDNO:549~560所示的扩增2019新型冠状病毒的引物组;如SEQIDNO:561~568所示的扩增人类冠状病毒HKU1的引物组;如SEQIDNO:569~574所示的扩增埃可病毒的引物组;如SEQIDNO:575~580所示的扩增脊髓灰质炎病毒1的引物组;如SEQIDNO:581~586所示的扩增脊髓灰质炎病毒3的引物组;如SEQIDNO:587~594所示的扩增脊髓灰质炎病毒1的引物组;如SEQIDNO:595~604所示的扩增肠道病毒D68型的引物组;如SEQIDNO:605~608所示的扩人冠状病毒HKU1的引物组。
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