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申请/专利权人:格瑞尔有限责任公司
摘要:在各种实施方式中,分析系统使用模型来确定疾病状态的特征和分类。疾病状态可以指示癌症的存在或不存在、癌症类型或者癌症的来源组织。所述模型可以包括二进制分类器和来源组织分类器。所述分析系统可以处理来自测试生物样品的序列读取,以产生用于训练所述分类器的数据。所述分析系统还可以使用机器学习技术的组合来训练所述模型,所述模型可以包括多层感知器。在一些实施方式中,所述分析系统使用甲基化信息来训练所述模型以确定关于疾病状态的预测。
主权项:1.一种分析序列读取以产生特征的方法,其包括:从第一参考样品产生第一多个参考序列读取,所述第一参考样品来自具有第一疾病状态的受试者;从第二参考样品产生第二多个参考序列读取,所述第二参考样品来自具有第二疾病状态的受试者,使用所述第一多个参考序列读取训练第一概率模型,所述第一概率模型与所述第一疾病状态相关;使用所述第二多个参考序列读取训练第二概率模型,所述第二概率模型与所述第二疾病状态相关;从训练样品产生多个训练序列读取,并且针对所述多个训练序列读取的每个序列读取:将所述序列读取应用于所述第一概率模型以确定第一概率值,所述第一概率值是来源于与所述第一疾病状态相关的样品的所述序列读取的概率,和将所述序列读取应用于所述第二概率模型以确定第二概率值,所述第二概率值是来源于与所述第二疾病状态相关的样品的所述序列读取的概率;和通过比较每个序列读取的所述第一概率值和所述第二概率值来鉴定一个或多个特征。
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百度查询: 格瑞尔有限责任公司 基于模型的特征化和分类
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