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基于大规模语言模型的多肽与TCR分子结合关系预测方法 

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申请/专利权人:中南大学

摘要:本发明公开了基于大规模语言模型的多肽与TCR分子结合关系预测方法,其包括以下步骤:S100、获取待测结合关系的多肽序列和TCR分子上的CDR3片段序列,对待测序列分别进行预处理得到目标输入序列;S200、将所述目标输入序列中的每个氨基酸残基进行特征编码,输出每个序列的编码矩阵;S300、将所述编码矩阵分别输入至训练好的结合关系预测模型中的双向GRU模块中,输出每个序列的全局特征矩阵;S400、将所述每对序列的全局特征矩阵合并后,输入至训练好的结合关系预测模型中的大规模语言模型RetNet中,输出每对序列的关系矩阵;S500、将所述每对序列的关系矩阵输入至结合关系预测模型中,输出所述待测结合关系的多肽序列和TCR分子上的CDR3片段序列的结合概率。

主权项:1.基于大规模语言模型的多肽与TCR分子结合关系预测方法,其特征在于,包括以下步骤:S100、获取待测结合关系的多肽序列和TCR分子上的CDR3片段序列,对待测序列分别进行预处理,得到目标输入序列;S200、将所述目标输入序列中的每个氨基酸残基进行特征编码,输出每个序列的编码矩阵;S300、将所述编码矩阵分别输入至训练好的结合关系预测模型中的双向GRU模块中,输出每个序列的全局特征矩阵;S400、将对应的所述每个序列的全局特征矩阵合并后,输入至训练好的结合关系预测模型中的大规模语言模型RetNet中,输出每对序列的关系矩阵;S500、将所述每对序列的关系矩阵输入至结合关系预测模型中,输出所述待测结合关系的多肽序列和TCR分子上的CDR3片段序列的结合概率。

全文数据:

权利要求:

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