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一种多甲基化尿路上皮癌早筛系统及模型构建方法 

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申请/专利权人:安徽安龙基因科技有限公司

摘要:本发明涉及基因检测技术领域,具体的说是一种多甲基化尿路上皮癌早筛系统及模型构建方法,包括获取模块,获取待筛查组织标本和癌旁标本;基因筛查模块,对获取模块获取的标本进行RRBS对比测序,筛选出特异度高、甲基化水平高的特异性标记基因;基因验证模块,通过BSP测序MSP扩增技术对初筛的标记基因进行验证;尿路上皮癌筛查模块,通过构建多基因甲基化检测试剂盒并结合统计学模型自动输出筛查结果,进而实现尿路上皮癌筛查;通过多基因甲基化联合检测并结合特定算法模型进一步提高其灵敏度与特异性,克服了单个基因标志物灵敏度低、多个基因标志物联合后特异度低的缺点。

主权项:1.一种多甲基化尿路上皮癌早筛系统,其特征在于,包括:获取模块,获取待筛查组织标本和癌旁标本;基因筛查模块,对获取模块获取的标本进行基于简化的甲基化测序技术对比测序,筛选出特异度高、甲基化水平高的特异性标记基因;基因验证模块,通过BSP测序MSP扩增技术对初筛的标记基因进行验证;尿路上皮癌筛查模块,通过多基因甲基化检测试剂盒结合统计学模型自动输出筛查结果,进而实现尿路上皮癌筛查,其中,所述统计学模型是基于训练集和验证集对逻辑回归模型进行训练得到的,训练集和验证集包括正常样本与癌症样本;所述多基因甲基化检测试剂盒包括:POU4F2基因检测引物探针序列SEQIDNO:1~SEQIDNO:3;Vimentin基因检测引物探针序列SEQIDNO:7~SEQIDNO:9;SOX1基因检测引物探针序列SEQIDNO:25~SEQ~IDNO27和ACTB基因检测引物探针序列SEQIDNO:31~SEQIDNO:33。

全文数据:

权利要求:

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