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龙图腾网恭喜广州源井生物科技有限公司申请的专利基因编辑位点的自动筛选方法、系统、装置及存储介质获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN112614541B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-03-11发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202011490090.9，技术领域涉及：G16B20/30；该发明授权基因编辑位点的自动筛选方法、系统、装置及存储介质是由许锦莹;林剑锋;刘晓凯;黄秋凤设计研发完成，并于2020-12-16向国家知识产权局提交的专利申请。

本基因编辑位点的自动筛选方法、系统、装置及存储介质在说明书摘要公布了：本发明公开了一种基因编辑位点的自动筛选方法、系统、装置及存储介质，该方法包括：获取基因名称及物种名称，并从基因数据库获取基因的序列、转录本信息及在染色体的位置信息；根据位置信息及转录本信息确定备选敲击区；对备选敲击区进行GC含量及复杂度分析确定敲击区；根据共有转录本数量及位置信息对敲击区进行排序；根据排序，通过敲击区的位置信息从基因的序列中截取敲击区序列；从gRNA在线设计软件获取敲击区序列的所有gRNA及对应的特异性得分及切割效率分数，并根据特异性得分及切割效率分数确定并展示gRNA的编辑位点。本发明实施例能够自动高效筛选敲除效果好且特异性强和切割效率高的基因编辑位点，可广泛应用于基因编辑技术领域。

本发明授权基因编辑位点的自动筛选方法、系统、装置及存储介质在权利要求书中公布了：1.一种基因编辑位点的自动筛选方法，其特征在于，包括：获取基因名称及物种名称，并根据所述基因名称及所述物种名称从基因数据库获取所述基因的序列、转录本信息及在染色体的位置信息；根据所述位置信息及所述转录本信息确定备选敲击区；对所述备选敲击区进行GC含量分析及复杂度分析确定敲击区；根据共有转录本数量及所述位置信息对所述敲击区进行排序；根据所述排序，通过所述敲击区的位置信息从所述基因的序列中截取所述敲击区序列；从gRNA在线设计软件获取所述敲击区序列的所有gRNA及对应的特异性得分及切割效率分数，并根据所述特异性得分及所述切割效率分数确定并展示gRNA的编辑位点；根据所述位置信息及根据所述转录本信息确定备选敲击区，包括步骤：根据所述位置信息确定敲击区范围；对所述敲击区范围的所述转录本进行预处理得到参考转录本；根据所述参考转录本的蛋白编码区的位置及长度和或外显子的位置及长度确定所述备选敲击区；所述对所述备选敲击区进行GC含量分析及复杂度分析确定敲击区，包括：在备选敲击区选取预设区域长度内的平均GC含量在预设区间；选取所述预设区间内没有预设复杂序列的区域作为敲击区；其中，所述预设复杂序列的区域包括：正向重复序列或反向重复序列大于50bp的区域，或，连续出现20个相同碱基的序列的区域，或，出现两次的环部小于25bp的发夹结构反向互补序列的区域；所述根据所述位置信息确定敲击区范围，包括步骤：基于所述基因在染色体上的位置信息，在所述染色体上检索确定若干个目标基因所对应的敲击区范围，所述目标基因中基因所在区段内不存在与所述基因重叠的编码蛋白的基因；所述对所述敲击区范围的所述转录本进行预处理得到参考转录本，包括步骤：基于所述敲击区范围内若干个目标基因的转录本信息筛除非编码蛋白和不完整的转录本，得到若干个第一目标转录本；基于目标位置信息确定存在蛋白编码区的若干个第二目标转录本，所述目标位置信息包括若干个第一目标转录本的起止位置、编码区的起止位置以及所述若干个第一目标转录本中外显子的位置；确定所述若干个第二目标转录本中长度最长的第二目标转录本作为参考转录本；所述根据所述参考转录本的蛋白编码区的位置及长度和或外显子的位置及长度确定所述备选敲击区，包括步骤：若敲除类型为移码敲除，则获取预设区域内的蛋白编码区作为第一敲击区，所述预设区域为所述参考转录本中从起始位置到起止位置一半长度的区域；将所述第一敲击区中长度处于第一长度范围内的目标蛋白编码区作为备选敲击区；若敲除类型为小片段敲除，则将满足终止位置位于所述预设区域内且长度处于第二长度范围内的外显子位置作为第二敲击区；合并相邻预设长度内的外显子并删除重复区域，将合并后满足终止位置位于所述预设区域内且长度处于第二长度范围内的外显子位置作为第三敲击区；将所述第二敲击区与所述第三敲击区作为备选敲击区；若敲除类型为大片段敲除，则合并相邻预设长度内的外显子并删除重复区域，确定合并后起始位置位于所述预设区域内的目标外显子；将所述目标外显子的起始位置作为起点，参考转录本中所有外显子的终止位置作为终点进行两两配对，组成处于预设大小范围内并按序排列的备选敲击区。

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