申请/专利权人:南开大学
申请日:2022-05-12
公开(公告)日:2022-08-26
公开(公告)号:CN114944190A
主分类号:G16B15/20
分类号:G16B15/20;G16B30/00
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2022.09.13#实质审查的生效;2022.08.26#公开
摘要:本发明公开了基于Hi‑C测序数据的TAD识别方法及系统;其中,所述方法包括:获取单条染色体的Hi‑C测序数据;对单条染色体的Hi‑C测序数据进行分段,生成若干个染色体片段;对每个染色体片段进行TAD结构识别;根据识别的TAD结构,识别假阳性结果。充分利用了整条染色体Hi‑C测序数据,提高了精度;同时引入随机重启游走算法和惩罚操作,通过惩罚系数有效的限制了基因变异带来的影响。
主权项:1.基于Hi-C测序数据的TAD识别方法,其特征是,包括:获取单条染色体的Hi-C测序数据;对单条染色体的Hi-C测序数据进行分段,生成若干个染色体片段;对每个染色体片段进行TAD结构识别;根据识别的TAD结构,识别假阳性结果。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 南开大学 基于Hi-C测序数据的TAD识别方法及系统
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