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【发明公布】基于Hi-C测序数据的TAD识别方法及系统_南开大学_202210512716.4 

申请/专利权人:南开大学

申请日:2022-05-12

公开(公告)日:2022-08-26

公开(公告)号:CN114944190A

主分类号:G16B15/20

分类号:G16B15/20;G16B30/00

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2022.09.13#实质审查的生效;2022.08.26#公开

摘要:本发明公开了基于Hi‑C测序数据的TAD识别方法及系统;其中,所述方法包括:获取单条染色体的Hi‑C测序数据;对单条染色体的Hi‑C测序数据进行分段,生成若干个染色体片段;对每个染色体片段进行TAD结构识别;根据识别的TAD结构,识别假阳性结果。充分利用了整条染色体Hi‑C测序数据,提高了精度;同时引入随机重启游走算法和惩罚操作,通过惩罚系数有效的限制了基因变异带来的影响。

主权项:1.基于Hi-C测序数据的TAD识别方法,其特征是,包括:获取单条染色体的Hi-C测序数据;对单条染色体的Hi-C测序数据进行分段,生成若干个染色体片段;对每个染色体片段进行TAD结构识别;根据识别的TAD结构,识别假阳性结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 南开大学 基于Hi-C测序数据的TAD识别方法及系统

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