申请/专利权人：西北农林科技大学

申请日：2020-01-03

公开（公告）日：2022-11-08

公开（公告）号：CN110964839B

主分类号：C12Q1/6888

分类号：C12Q1/6888;C12Q1/6851

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2022.11.08#授权;2020.05.01#实质审查的生效;2020.04.07#公开

摘要：本发明公开了一种SERPINA3‑1基因CNV标记辅助检测黄牛生长性状的方法及其应用。该方法基于实时荧光定量PCR，以黄牛基因组DNA为模板，扩增黄牛SERPINA3‑1基因的拷贝数变异区域及内参基因BTF3基因的部分片段，运用2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。基于黄牛SERPINA3‑1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，本发明提供的方法可用于快速建立种质资源优良的黄牛种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。

主权项：1.一种检测黄牛SERPINA3-1基因拷贝数变异的方法在黄牛分子标记辅助选择育种中的应用，其特征在于：所述检测黄牛SERPINA3-1基因拷贝数变异的方法，包括以下步骤：以待测黄牛的基因组DNA为模板，以引物对P1和P2为引物，分别通过实时荧光定量PCR扩增SERPINA3-1基因的拷贝数变异区域和作为内参的BTF3基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定黄牛SERPINA3-1基因的拷贝数变异类型；所述黄牛为皮南牛、夏南牛、独龙牛或云岭牛；所述的SERPINA3-1基因的拷贝数变异区域位于牛SERPINA3-1基因候选区域Chr21：60097201-60113200；所述的拷贝数变异类型是根据Log22-∆∆Ct将定量结果分为的三类：插入型，Log22-∆∆Ct0.5；缺失型，Log22-∆∆Ct-0.5；正常型，-0.5≤Log22-∆∆Ct≤0.5；所述的黄牛中，具有插入型拷贝数变异类型的个体在生长性状上优于缺失型和正常型拷贝数变异类型的个体；所述的生长性状为体高、十字部高、腰角宽、尻长中的一种或多种；所述的引物对P1为：上游引物F1：5’-ACTTAGACCCTGTGGTAGGTCA-3’；下游引物R1：5’-ATGATCACAAACTACCTCTGGATAC-3’；所述的引物对P2为：上游引物F2：5’-AACCAGGAGAAACTCGCCAA-3’；下游引物R2：5’-TTCGGTGAAATGCCCTCTCG-3’。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 西北农林科技大学 一种SERPINA3-1基因CNV标记辅助检测黄牛生长性状的方法及其应用

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