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用于鉴定水稻抗褐飞虱基因Bph30的SNP标记及其应用 

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申请/专利权人:袁隆平农业高科技股份有限公司;湖南隆平高科种业科学研究院有限公司;湖南亚华种业科学研究院;武汉大学

摘要:本发明提供一种用于鉴定水稻抗褐飞虱基因Bph30的SNP标记及其应用。所述SNP标记位于水稻4号染色体第946632bp处,多态性为AG。本发明针对该SNP位点设计相应的KASP检测引物,通过检测该SNP位点的多态性判断检测植株是否含有水稻抗褐飞虱基因Bph30。本发明提供的SNP标记可以有效鉴别植株中抗褐飞虱基因Bph30基因型。本发明提供的SNP标记及其KASP引物具有操作简单、成本低廉、周期短等优点,且该标记位于Bph30基因内,稳定性好,不受其他基因效应或环境因素的影响,应用于分子辅助选择中,可加快Bph30基因在抗飞虱育种中的应用,显著缩短抗褐飞虱水稻品种的选育周期,降低选育成本。

主权项:1.鉴定水稻抗褐飞虱基因Bph30的方法,其特征在于,包括:1提取待测水稻基因组DNA;2以水稻基因组DNA为模板,利用KASP引物组合进行PCR检测;3分析PCR产物:若PCR产物中包含用于鉴定水稻抗褐飞虱基因Bph30的SNP标记中的多态性为A的碱基,则判定待测水稻中含有水稻抗褐飞虱基因Bph30;若PCR产物中包含所述SNP标记中的多态性为G的碱基,则判定待测水稻中不含有水稻抗褐飞虱基因Bph30;其中,用于鉴定水稻抗褐飞虱基因Bph30的SNP标记的核苷酸序列如SEQIDNO:4所示,其中第101位碱基n为a或g;所述KASP引物组合包括如SEQIDNO:1和2所示的两条特异性引物以及如SEQIDNO:3所示的一条通用引物;其中,两条特异性引物分别含有不同的荧光基团。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 袁隆平农业高科技股份有限公司 湖南隆平高科种业科学研究院有限公司 湖南亚华种业科学研究院 武汉大学 用于鉴定水稻抗褐飞虱基因Bph30的SNP标记及其应用

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