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申请/专利权人:上海交通大学医学院附属第九人民医院
摘要:本发明提供一种基于FFPE组织的质谱蛋白质组学样品的前处理方法,包括:获得脱蜡处理后的FFPE组织、高温高压提取脱蜡处理后的FFPE组织中的蛋白质、将所得蛋白质制备为蛋白样品、将所得蛋白样品酶解、将酶解后样品除盐,即得FFPE组织的质谱蛋白质组学样品;本发明的方法在裂解液中高温高压提取蛋白质,在样本解交联的同时可以达到更高效的蛋白提取,检测到更多的组织中肽段,在保证肽段产率和低漏切率的同时,获得更高的鉴定率,尤其对于陈旧FFPE样本效果更为明显;本发明的前处理方法具有用时短、成本低、提取效率高、样本重复性好、操作简单方便、同时减少了样本储存时间对样本的影响等优点。
主权项:1.一种基于FFPE组织的质谱蛋白质组学样品的前处理方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、获得脱蜡处理后的FFPE组织;S2、高温高压提取脱蜡处理后的FFPE组织中的蛋白质;S3、将步骤S2所得蛋白质制备为蛋白样品;S4、将步骤S3所得蛋白样品酶解;S5、将步骤S4酶解后样品除盐,即得FFPE组织的质谱蛋白质组学样品。
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权利要求:
百度查询: 上海交通大学医学院附属第九人民医院 一种基于FFPE组织的质谱蛋白质组学样品的前处理方法
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