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一种具有抑制大肠杆菌外排泵的芸香苷 

申请/专利权人:河北农业大学

申请日:2024-01-30

公开(公告)日:2024-05-03

公开(公告)号:CN117959321A

主分类号:A61K31/7048

分类号:A61K31/7048;G16C10/00;A61P31/04;A01N43/16;A01P1/00

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.05.21#实质审查的生效;2024.05.03#公开

摘要:本发明涉及芸香苷技术领域,且公开了一种具有抑制大肠杆菌外排泵的芸香苷,包括以下步骤:首先菌株的复壮与培养,其次化学药品和贮存液的制备,再进行AcrB蛋白和中药单体化合物的处理,然后基于分子对接技术的AcrB蛋白配体的虚拟筛选,之后对芸香苷分子动力学模拟与MM‑PBSA计算,再进行体外抑菌试验,最后获得具有抑制大肠杆菌外排泵的芸香苷。通过小分子化合物数据库进行大规模筛选,找出能与生物靶标发生相互作用并调节其相关功能的小分子药物,通过计算药物分子与靶点之间的相互作用力,预测其对接分数,能够缩小候选药物范围并为药物分子的设计和优化提供依据,加速药物研发进程、降低药物开发成本。

主权项:1.一种具有抑制大肠杆菌外排泵的芸香苷,其特征在于:包括以下步骤:S1:菌株的复壮与培养;S2:化学药品和贮存液的制备;S3:AcrB蛋白和中药单体化合物的处理;S4:基于分子对接技术的AcrB蛋白配体的虚拟筛选;S4.1:中药小分子数据库的初步虚拟筛选;S4.2:分子对接精确验证药物分子;S4.3:通过ADMET预测反应药物在体内吸收、分布、代谢等情况;S5:对芸香苷分子动力学模拟与MM-PBSA计算;S5.1:对芸香苷分子动力学模拟获取化合物与受体的结合情况数据;S5.2:通过轨迹处理和MM-PBSA计算分析氨基酸残基的结合自由能;S6:进行体外抑菌试验;S6.1:通过联合抑菌试验得到分级抑菌浓度指数;S6.2:通过尼罗红外排试验,获取大肠杆菌E320菌株AcrB蛋白的外排活性;S6.3:通过外膜渗透性试验,测定芸香苷对细胞外膜渗透性有无影响;S6.4:获取内膜质子梯度参数数据;S7:获得具有抑制大肠杆菌外排泵的芸香苷。

全文数据:

权利要求:

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