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申请/专利权人：张升校

摘要：本发明公开一种槐蕾茶抗新型冠状病毒感染的靶点筛选方法，属于医药技术领域。通过活性成分的筛选及靶标预测；分子对接配体与受体的准备；成分靶点分子对接筛选活性成分；疾病靶点的预测；构建化合物‑靶点‑疾病网络；关键靶点功能富集分析。本研究采用网络药理学方法及分子对接技术探究槐蕾针对COVID‑19的活性成分及潜在靶点，进行分子对接验证，构建成分‑靶点网络，与连花清瘟胶囊与金花清感颗粒进行对比，探究其机制作用通路，为后续基础实验提供思路。

主权项：1.一种槐蕾茶抗新型冠状病毒感染的靶点筛选方法，其特征在于：包括以下步骤：步骤1、活性成分的筛选及靶标预测；步骤2、分子对接配体与受体的准备；步骤3、成分靶点分子对接筛选活性成分；步骤4、疾病靶点的预测；步骤5、构建化合物-靶点-疾病网络；步骤6、关键靶点功能富集分析；所述步骤1、活性成分的筛选及靶标预测的具体方法是：在中药系统药理学数据库及分析平台TCMSP检索槐蕾茶已知活性成分，设置口服生物利用度OB≥30%和类药性DL≥0.18，筛选槐蕾茶活性成分，并查询得到活性成分对应的靶点，使用Uniprot数据库验证有效靶点对应的基因名称；所述步骤2、分子对接配体与受体的准备的具体方法是：从TCMSP中导出槐蕾茶活性成分mol2结构，通过OpenBabelGUI选用MMFF94力场进行能量优化，并保存为mol2格式；通过AutoDockTools-1.5.6赋予配体原子类型、进行电荷计算，并定义所有柔性键可旋转，保存为pdbqt格式；从PDB数据库中下载SARS-CoV-23CL水解酶、SARS-CoV-2S蛋白ACE2和木瓜蛋白酶的PDB格式，导入PyMOL软件去水分子，分离蛋白；导入AutoDockTools-1.5.6中进行添加极性氢，计算Gasteiger电荷并分配电荷，保存为pdbqt文件；所述步骤3、成分靶点分子对接筛选活性成分的具体方法是：AutoDockTools软件分别设置受体的格点参数文本文件，energy_range=3，num_modes=10，exhaustiveness=8；运用AutodockVina软件在linux虚拟环境下进行对接，选取结合自由能小且构象较好的作为结果；选取结合能≤-5.0kJmol的化合物作为槐蕾茶治疗新型新型冠状病毒感染的活性成分；所述步骤4、疾病靶点的预测的具体方法是：分别以“2019-nCoV”、“NovelCoronavirusPneumonia”、“coronavirusdisease2019”、“novelcoronavirus2019”为检索词查询Genecards数据库导出，新型新型冠状病毒感染相关基因靶点，筛选得分≥1的基因；所述步骤5、构建化合物-靶点-疾病网络的具体方法是：将槐蕾茶活性成分潜在靶点和疾病靶点分别通过Venny2.1.0工具取交集，将交集内靶点导入STRING11.0平台，物种设置为“homosapiens”，设置置信度“minimumrequiredinterationscore”为“mediumconfidence0.400”，隐藏网络中断开连接的节点；整合蛋白相互作用信息与化合物-靶点信息分别构建化合物-靶点网络，运用“NetworkAnalyzer”功能进行拓扑学分析度值Degree、介数中心性BetweennessCentrality、紧密中心性ClosenessCentrality；将槐蕾茶PPI网络通过“Merge”功能进行合并，得到槐蕾茶治疗新型冠状病毒感染靶点关系；所述步骤6、关键靶点功能富集分析的具体方法是：运用“MCODE”功能将槐蕾茶治疗新型冠状病毒感染靶点网络进行聚类分析筛选，通过Metascape在线分析平台进行BiologicalProcess、CellularComponent、MolecularFunction与KEGGPathway分析。

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