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申请/专利权人：昆明学院
摘要：本发明属于基因表达谱构建技术领域，公开了一种抗感两种魔芋材料不同Pcc侵染阶段基因表达谱构建方法，所述抗感两种魔芋材料不同Pcc侵染阶段基因表达谱构建方法包括Pcc接种魔芋与样本采集；魔芋总RNA的提取、cDNA文库构建与质检测序；进行测序数据质控与参考序列比对分析、基因表达量分析和样本关系分析、差异表达基因筛选与富集分析和加权共表达网络分析。由此表明MAPK信号转导在A.muelleri免疫反应的激活方面具有重要作用。此外，JA信号通路也同时参与了两种魔芋对软腐病的防御反应，外源MeJA预处理试验证实，其可以减轻魔芋球茎软腐病的发病程度，MeJA预处理的病情指数较对照降低约13.75％。
主权项：1.一种抗感两种魔芋材料不同Pcc侵染阶段基因表达谱构建方法，其特征在于，包括以下步骤：第一步，Pcc接种魔芋与样本采集，选择在温室生长5个月后的生长状态良好且完全健康的A.konjac和A.muelleri植株，将100μL的Pcc菌液1×108CFUmL接种于叶柄基部1-2cm处，同时接种等量的无菌水作为对照；第二步，魔芋总RNA的提取、cDNA文库构建与质检测序，参照Reagent试剂盒步骤提取魔芋根和叶柄组织中的总RNA，用NanoDrop2000对所提的RNA的纯度和浓度进行检测，用琼脂糖凝胶电泳检测RNA的质量，用Agilent5300生物分析仪检测RNA的完整性，提取出的RNA一部分用于转录组测序；第三步，进行测序数据质控与参考序列比对分析、基因表达量分析和样本关系分析、差异表达基因筛选与富集分析和加权共表达网络分析。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 昆明学院 抗感两种魔芋材料不同Pcc侵染阶段基因表达谱构建方法
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