申请/专利权人:集美大学
申请日:2021-04-27
公开(公告)日:2024-06-18
公开(公告)号:CN113223617B
主分类号:G16B30/10
分类号:G16B30/10;G16B35/20;G16B40/00;G16B20/30
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2024.06.18#授权;2021.08.24#实质审查的生效;2021.08.06#公开
摘要:本发明公开了一种筛选盐激活性PL7家族褐藻胶裂解酶的方法。包括结合CAZy和NCBI数据库获取PL7家族褐藻胶裂解酶的氨基酸序列集;再对其氨基酸序列信息进行分析,以盐激活性PL7家族褐藻胶裂解酶的盐激活特征指数为筛选依据进行特征排序,盐激活特征指数小的为高盐激活性PL7家族褐藻胶裂解酶,盐激活特征指数大的为低盐激活性PL7家族褐藻胶裂解酶。所述方法借助于盐激活性PL7家族褐藻胶裂解酶的氨基酸序列偏好性质,通过数据库检索、特征值筛选等手段最终得到高效表达重组盐激活PL7家族褐藻胶裂解酶的基因工程菌,其表达的PL7家族褐藻胶裂解酶具有良好的盐环境适应性,可用于高盐环境下的褐藻胶生物催化降解。
主权项:1.一种筛选盐激活性PL7家族褐藻胶裂解酶的方法,其特征在于,包括以下步骤:样本集的建立:结合CAZy数据库和NCBI数据库,检索获取PL7家族褐藻胶裂解酶的氨基酸序列集;盐激活性特征值筛选:对上述氨基酸序列集中的氨基酸序列信息进行分析,再以盐激活性PL7家族褐藻胶裂解酶的盐激活特征指数为筛选依据进行特征排序,盐激活特征指数小的为高盐激活性PL7家族褐藻胶裂解酶,盐激活特征指数大的为低盐激活性PL7家族褐藻胶裂解酶;所述盐激活性PL7家族褐藻胶裂解酶的盐激活特征指数为酸性氨基酸的含量除以碱性氨基酸的含量,即为E+DH+K+R。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 集美大学 一种筛选盐激活性PL7家族褐藻胶裂解酶的方法
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