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申请/专利权人：西南民族大学
申请日：2024-03-30
公开（公告）日：2024-06-25
公开（公告）号：CN118248226A
主分类号：G16B40/00
分类号：G16B40/00;G16B20/20;G16B20/40
优先权：
专利状态码：在审-公开
法律状态：2024.06.25#公开
摘要：本发明公开了一种牛属动物群体亲缘关系重建方法，利用基因型文件转变为0,1,2型的文件进行亲缘关系分析，通过亲缘关系可以准确还原出谱系，找出个体的父本和母本，尤其是对于牛这种大多没有记录谱系关系的养殖家畜，亦或者是对于猪这种有明确记录谱系的家畜，能利用基因型数据还原谱系对人工记录的谱系数据缺失、错误进行填补和更正。同时还能对谱系进行统计分析和通过谱系与基因型两种不同的方法计算近交系数，并能生成表格文件或者谱系图储存在电脑硬盘中，并能利用已有谱系进行统计分析得出群体中的公母数、产子数、代数等；为后续家畜养殖中的育种选种作为一个参考。
主权项：1.一种牛属动物群体亲缘关系重建方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、获取牛基因型数据，并将牛基因型数据转变为0,1,2型的SNP文件；S2、对SNP文件中的每一个个体进行两两配对，对于已配对的个体，假定他们可能具有亲子关系、全同胞关系、半同胞关系或者没有亲缘关系；并通过sequoia软件计算配对个体之间的亲子关系、全同胞关系、半同胞关系的似然值log10对数，取最大值为配对个体之间的亲缘关系；去掉无亲缘关系行，最后通过亲缘关系还原系谱；S3、区分个体在系谱中所在的代数并找到新生代个体，通过新生代个体以一个个体只有一父一母的原理来还原系谱，并输出结果。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 西南民族大学 一种牛属动物群体亲缘关系重建方法
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