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申请/专利权人：复旦大学附属肿瘤医院
申请日：2024-03-05
公开（公告）日：2024-06-28
公开（公告）号：CN118262793A
主分类号：G16B35/10
分类号：G16B35/10;G16B30/00;G16B50/00
优先权：
专利状态码：在审-公开
法律状态：2024.06.28#公开
摘要：本发明提供了一种高效选择多价肿瘤新抗原组合的系统，旨在输入多个肿瘤新抗原肽段序列，并从这些序列构成的随机组合肽段池中筛选出具有最优化蛋白序列的组合，该系统包含三个关键模块：库构建模块、最优路径选择模块和连接子添加模块，库构建模块负责生成一个包含输入肽段序列所有可能组合的库，并计算每种组合的潜在效用。最优路径选择模块进一步负责从这些组合中筛选出最佳的蛋白序列组合，确保肽段之间的关联既准确又多样化。该模块通过精确筛选，挑选出能以最少的连接子生成、避免产生非预期新抗原且结构松散的多价肿瘤新抗原疫苗序列的最佳路径，最后，连接子添加模块在所需位置精确添加连接子，旨在形成结构稳定且灵活的完整蛋白序列，同时最大限度地减少连接子的使用，优化整体序列的设计。本发明通过这种创新的方法，生成的多价肿瘤新抗原组合序列不仅使用了更少的连接子，结构简洁，而且在最大程度上减少了非预期新抗原的产生，有效地应对了多价抗原设计的挑战。
主权项：1.一种选择多价肿瘤新抗原组合的系统，其特征在于，包括以下步骤:库构建模块，用以计算输入列表中每个新抗原肽段序列前端和后端相对应的可选库；最优路径选择模块，用以确定输入列表中肽段序列的最佳排序，通过迭代的方式，逐个添加具有最小化自定义目标函数值的目标肽段序列到路径中，最终得到的路径即为所选择的最优路径，代表了输入列表中肽段序列的最佳排序；连接子添加模块，用以检查所述最佳排序的序列中需要添加连接子的部分，并从连接子库中筛选出合适的连接子，确保所述最佳排序的序列不会产生非预期新抗原。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 复旦大学附属肿瘤医院 一种选择多价肿瘤新抗原组合系统和方法
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