申请/专利权人：湖北大学

申请日：2024-03-20

公开（公告）日：2024-06-28

公开（公告）号：CN118255853A

主分类号：C07K14/39

分类号：C07K14/39;C12N15/31;C12N15/81;C12N1/19;G16B5/00;G16B10/00;G16B20/00;G16B30/10;G16B30/00;C12R1/865

优先权：

专利状态码：在审-公开

法律状态：2024.06.28#公开

摘要：本发明涉及一种木糖转运蛋白基因Xt7及其蛋白构建方法和应用，本发明通过来自中间假丝酵母的Gxf1和树干毕赤酵母的Sut1作为靶点，利用祖先序列重建的方法去复活祖先木糖转运蛋白的氨基酸序列，得到祖先节点Xt7的氨基酸序列，经过密码子优化在酿酒酵母中异源表达，得到木糖转运蛋白基因Xt7，并表达得到有活性的功能蛋白，通过实验表明转运蛋白Xt7应用在酿酒酵母中时在木糖转运方面表现出优势，且Xt7在葡萄糖存在时转运木糖时表现出更少的受葡萄糖抑制的倾向，本发明首次通过祖先序列重建复活祖先的策略获得木糖转运蛋白，改进了酿酒酵母的木糖转运能力，为工业发酵工程提供了新的策略和方向。

主权项：1.利用祖先序列重建获得木糖转运蛋白基因Xt7及其蛋白的方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1、氨基酸序列的收集：选择Gxf1和Sut1作为目标蛋白，构建一个包括多个同源蛋白质序列的数据集；步骤2、多序列比对：在数据集中去除和目标氨基酸序列长度差异显著的同源序列，并除去冗余的序列，获得多个同源氨基酸序列，对除去冗余后的多个序列进行多序列比对分析，比对结果进行可视化分析，分析同源序列的保守性序列，剔除影响比对整齐性的序列以及手动校正序列中非保守区域的整齐性，提高间隙处的可靠性，再次使用MAFFT重新比对，得到多序列对比文件；步骤3、模型评估：将最终生成的多序列比对文件利用ProtTest得到氨基酸最优取代模型LG+I+G；步骤4、构建系统发育树：依据LG+I+G氨基酸取代模型对多序列对比文件运行多次引导的最大似然构建系统发育树，由在线工具对构建的系统发育树进行可视化输出；步骤5、根据LG模型对输入的系统发育树和多序列比对文件进行祖先序列重建，得到祖先节点的蛋白质序列后除去冗余序列得到祖先序列重建数据；对祖先序列重建数据进行可视化分析得到祖先序列树枝图，通过分析祖先节点和NCBI现有数据库的相似性，筛除祖先序列树枝图上相似度大于95％的祖先节点，从剩余的祖先节点中选取N7号节点，并命名为祖先节点Xt7，对于祖先节点Xt7通过PAML软件的FastCodeML模块进行重建得到对应的氨基酸序列，如SEQIDNO：1所示；步骤6、利用祖先节点Xt7的氨基酸序列得到木糖转运蛋白Xt7的基因，对木糖转运蛋白Xt7的基因进行表达得到木糖转运蛋白Xt7。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 湖北大学 木糖转运蛋白基因Xt7及其蛋白构建方法和应用

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

阅读全文 双屏查看 官方信息 专利公告 收藏专利 下载PDF 下载WORD