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申请/专利权人：吉林省养蜂科学研究所(吉林省蜂产品质量管理监督站、吉林省蜜蜂遗传资源基因保护中心)
申请日：2024-03-25
公开（公告）日：2024-06-28
公开（公告）号：CN118256626A
主分类号：C12Q1/6888
分类号：C12Q1/6888;C12N15/11;G16B20/30
优先权：
专利状态码：在审-公开
法律状态：2024.06.28#公开
摘要：本发明公开了基于电子PCR识别样本PCR扩增子长度多态性的保种蜜蜂STRs分型方法。本发明通过将在线扩增得到的蜜蜂参考基因组STRs位点的电子PCR扩增子加减STRs位点的重复核苷酸序列得到电子多态性长度值，以此与样本PCR扩增子长度分布区间中的样本分布断裂带进行比较，校正STRs位点的分型，获得精准划分的蜜蜂16个STRs位点的多态性分型。然后基于STRs位点的多态性分型，通过固定系数计算方法评估保种蜜蜂16个STRs位点的群体结构。本发明的方法既可应用于评估不同蜂场中各蜜蜂亚群相对于蜜蜂总群的近交系数，也可应用于评估同一个蜂场中各蜜蜂亚群相对于蜜蜂总群的近交系数。具有广泛的应用前景。
主权项：1.对蜜蜂STRs位点进行分型的方法，其特征在于：所述方法包括选择针对蜜蜂STRs位点的PCR引物对待测蜜蜂群体的基因组进行PCR扩增得到扩增产物，通过毛细管电泳测定所述扩增产物的长度，得到STRs位点的PCR扩增子长度测定值；基于所述PCR扩增子长度测定值确定所述待测蜜蜂群体中所述STRs位点的PCR扩增子长度多态性分布区间；使用所述PCR引物序列在参考蜜蜂基因组序列上进行比对获得所述STRs位点的电子PCR扩增子；基于所述PCR扩增子长度多态性分布区间确定所述STRs位点的PCR扩增子样本分布断裂带长度值，将所述电子PCR扩增子的长度值加上或减去n个所述STRs位点的重复核苷酸序列长度值得到所述STRs位点的电子多态性长度值；通过比较所述样本分布断裂带长度值和所述电子多态性长度值确定所述STRs位点的PCR扩增子长度多态性的节点值，或，通过将所述样本分布的断裂带长度值加上或减去n个所述STRs位点的重复核苷酸序列长度值后与其他所述样本分布的断裂带长度值进行比较确定所述节点值；通过比较所述PCR扩增子长度测定值和所述节点值获得所述STRs位点的分型；所述样本分布断裂带长度值为所述STRs位点的PCR扩增子长度多态性分布区间中没有样本分布的所述PCR扩增子长度值；所述n为自然数。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 吉林省养蜂科学研究所(吉林省蜂产品质量管理监督站、吉林省蜜蜂遗传资源基因保护中心) 基于电子PCR识别样本PCR扩增子长度多态性的保种蜜蜂STRs分型方法
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