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一种基于miRNA诊疗的基因电路设计方法 

申请/专利权人:单明亮

申请日:2024-04-11

公开(公告)日:2024-06-28

公开(公告)号:CN118262803A

主分类号:G16B50/00

分类号:G16B50/00;G16B50/30;G16B40/10;G16B30/00;G16B25/20;G16B25/10

优先权:

专利状态码:在审-公开

法律状态:2024.06.28#公开

摘要:本发明公开了一种基于miRNA诊疗的基因电路设计方法,该方法提高了基因电路的可扩展性,实现多信号的接收,进一步提高了基因电路的特异性。其运用了生物信息学手段,并基于靶细胞与非靶细胞基因表达差异,建立基因电路组成元件,可根据不同靶细胞与非靶细胞基因表达差异情况,通过筛选方案,确认其各个组成元件,提高了灵活性及适应性。该基因电路借用了逻辑电路里面的相关概念,电路通过“与、或、非”门来实现逻辑判断和计算。同样,将基因设计成类似“与、或、非”门的逻辑关系来发挥诊疗效果,解决了特定目的基因在靶细胞的选择性表达,从而发挥基因在特定细胞的目标生理作用。

主权项:1.一种基于miRNA诊疗的基因电路设计方法,该方法步骤如下:步骤一,获取待筛选的基因表达量,通过统计学的方法对高通量的基因数据进行筛选,选取目标基因集;其目标基因集选取方法步骤具体包括步骤:步骤a,mRNA差异表达基因的筛选:获取mRNA基因在靶细胞和非靶细胞的差异表达数据,将靶细胞和非靶细胞mRNA表达量进行比较,进行差异基因筛选,筛选出mRNA差异表达基因;步骤b,miRNA差异表达基因的筛选:获取miRNA基因在靶细胞和非靶细胞的差异表达数据,将靶细胞和非靶细胞miRNA表达量进行比较,进行差异基因筛选;筛选出具有miRNA差异表达的基因;步骤c,将步骤b中筛选出的miRNA差异表达基因,构建其对应的海绵体Sponge,优先选择其中亲和力和特异性较高的;步骤d,将步骤a中筛选出的mRNA差异表达基因,根据以下条件进一步筛选,功能信号基因模块的筛选:需为调控其它基因的基因;步骤e,探测信号基因模块的筛选:需为被调控的基因;步骤二,构建相应的基因电路元件模型库,以细胞内基因的表达调控过程为基础,基于各组成元件之间的相互作用关系,其中基因电路元件模型库借用逻辑电路里面的相关逻辑概念,电路通过各种逻辑门来实现对数字的逻辑判断和计算,通过与不同功能基因组件的不同结合从而发挥不同的目标功能。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 单明亮 一种基于miRNA诊疗的基因电路设计方法

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