申请/专利权人：MD保健株式会社

申请日：2018-02-23

公开（公告）日：2024-06-28

公开（公告）号：CN110546278B

主分类号：C12Q1/689

分类号：C12Q1/689;C12Q1/6883

优先权：["20170224 KR 10-2017-0025084","20170512 KR 10-2017-0059081"]

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.06.28#授权;2019.12.31#实质审查的生效;2019.12.06#公开

摘要：本发明涉及一种通过细菌宏基因组学分析诊断诸如哮喘、COPD等慢性阻塞性气道疾病的方法，更具体地，涉及一种经由通过使用来源于受试者的样品进行的细菌宏基因组分析来分析来源于特定细菌中的细胞外囊泡的含量的增加或减少，从而诊断慢性阻塞性肺疾病和哮喘的方法。从环境中存在的细菌分泌的细胞外囊泡被吸收到人体内，因此可能直接影响炎症反应，并且在症状出现之前很难早期诊断出慢性阻塞性气道疾病如哮喘、COPD等，因此对其有效治疗是困难的。因而，根据本发明，通过使用来源于人体的样品，通过对存在于来源于细菌的细胞外囊泡中的基因的宏基因组分析，可以预测发生慢性阻塞性气道疾病如哮喘、COPD等的风险，因此通过对慢性阻塞性气道疾病的风险组的早期诊断和预测经由适当管理，可以延迟或者防止慢性阻塞性气道疾病的发作，并且甚至在慢性阻塞性气道疾病如哮喘、COPD等发生后，可以实现对慢性阻塞性气道疾病的早期诊断，从而降低慢性阻塞性气道疾病的发病率以及提高治疗效果。

主权项：1.一对如SEQIDNO:1和SEQIDNO:2序列所示的引物对在制备用于诊断慢性阻塞性肺病COPD或哮喘的方法的组合物中的用途，该方法包括：a从分离自受试者血液样品的细胞外囊泡（EV）中提取DNA；b使用所述引物对对提取的DNA进行聚合酶链式反应PCR；（c）对PCR产物进行测序;（d）分析测序的PCR产物，以确定EV来源的细菌的身份以及细菌来源的EV的数量;和（e-1）检测受试者血液样品中细菌来源EV的数量比从正常对照个体获得的样品增加或减少两倍或更多来诊断COPD，或（e-2）检测受试者血液样品中细菌来源EV的数量比从正常对照个体获得的样品增加或减少两倍或更多来诊断哮喘，其中在（e-1）中，EV来源于以下细菌：嗜氢菌属Hydrogenophilus、变形杆菌属Proteus、土芽孢杆菌属Geobacillus、色盐杆菌属Chromohalobacter、红杆菌属Rubrobacter、巨单胞菌属Megamonas、苏黎世杆菌属Turicibacter、红球菌属Rhodococcus、考拉杆菌属Phascolarctobacterium、SMB53属、脱硫弧菌属Desulfovibrio、咸海鲜球菌属Jeotgalicoccus、克劳斯氏菌属Cloacibacterium、克雷伯氏菌属Klebsiella、埃希氏菌属Escherichia、贪铜菌属Cupriavidus、安德克氏菌属Adlercreutzia、梭菌属Clostridium、粪便杆菌属Faecalibacterium、寡养单胞菌属Stenotrophomonas、葡萄球菌属Staphylococcus、戈登氏菌属Gordonia、微球菌属Micrococcus、粪球菌属Coprococcus、新鞘氨醇杆菌属Novosphingobium、水栖菌属Enhydrobacter、柠檬酸杆菌属Citrobacter和短波单胞菌属Brevundimonas，其中以下细菌来源的EV数量增加了两倍或更多：粪便杆菌属Faecalibacterium、寡养单胞菌属Stenotrophomonas、葡萄球菌属Staphylococcus、戈登氏菌属Gordonia、微球菌属Micrococcus、粪球菌属Coprococcus、新鞘氨醇杆菌属Novosphingobium、水栖菌属Enhydrobacter、柠檬酸杆菌属Citrobacter和短波单胞菌属Brevundimonas，以及以下细菌来源的EV数量减少了两倍或更多：嗜氢菌属Hydrogenophilus、变形杆菌属Proteus、土芽孢杆菌属Geobacillus、色盐杆菌属Chromohalobacter、红杆菌属Rubrobacter、巨单胞菌属Megamonas、苏黎世杆菌属Turicibacter、红球菌属Rhodococcus、考拉杆菌属Phascolarctobacterium、SMB53属、脱硫弧菌属Desulfovibrio、咸海鲜球菌属Jeotgalicoccus、克劳斯氏菌属Cloacibacterium、克雷伯氏菌属Klebsiella、埃希氏菌属Escherichia、贪铜菌属Cupriavidus、安德克氏菌属Adlercreutzia和梭菌属Clostridium，在（e-2）中，EV来源于以下细菌：葡萄球菌属Staphylococcus、丙酸杆菌属Propionibacterium、微球菌属Micrococcus、不动杆菌属Acinetobacter、棒状杆菌属Corynebacterium、假单胞菌属Pseudomonas、乳酸杆菌属Lactobacillus、阿克曼氏菌属Akkermansia、克雷伯氏菌属Klebsiella、副拟杆菌属Parabacteroides、韦荣氏球菌属Veillonella、拟杆菌属Bacteroides、双歧杆菌属Bifidobacterium和肠杆菌属Enterobacter，其中以下细菌来源的EV数量增加了两倍或更多：克雷伯氏菌属Klebsiella、副拟杆菌属Parabacteroides、韦荣氏球菌属Veillonella、拟杆菌属Bacteroides、双歧杆菌属Bifidobacterium和肠杆菌属Enterobacter，以及以下细菌来源的EV数量减少了两倍或更多：葡萄球菌属Staphylococcus、丙酸杆菌属Propionibacterium、微球菌属Micrococcus、不动杆菌属Acinetobacter、棒状杆菌属Corynebacterium、假单胞菌属Pseudomonas、乳酸杆菌属Lactobacillus和阿克曼氏菌属Akkermansia。

全文数据：

权利要求：

百度查询： MD保健株式会社 通过细菌宏基因组分析来诊断慢性阻塞性呼吸道疾病的方法

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

阅读全文 双屏查看 官方信息 专利公告 收藏专利 下载PDF 下载WORD