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一种基于16S rRNA测序数据预测人体肠道健康状况的方法及其应用 

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申请/专利权人:上海宝藤生物医药科技股份有限公司;上海宝藤医学检验所有限公司;上海华藤生物科技有限公司

摘要:本发明提供了一种基于16SrRNA测序数据预测人体肠道健康状况的方法及其应用,包括:筛选代谢物小分子以及其主要生物途径中相关的酶;基于16SrRNA分析产生的OTUASV,构建包含参考基因组和环境采样生物的系统树,用于预测每个OTUASV的个体基因家族拷贝数;基于拷贝数预测采样序列的基因组含量;基于基因组含量预测酶活性相关基因家族的相对丰度谱,结合已知的功能注释数据库,预测每个样本中各个酶的相对丰度谱;酶的相对丰度谱反映了肠道内酶的活性,构建酶‑代谢物‑人体肠道微生态健康状况的生物网络,根据相关功能酶活性进行人体肠道微生态健康的评估监控,以相关的酶活性变化反映人体肠道微生态健康状况。

主权项:1.一种基于16SrRNA测序数据预测人体肠道健康状况的方法,其特征在于,所述方法包括:筛选代谢物小分子以及其主要生物途径中相关的酶;基于16SrRNA分析产生的OTUASV,构建包含参考基因组和环境采样生物的系统树,用于预测每个OTUASV的个体基因家族拷贝数;基于拷贝数预测采样序列的基因组含量;基于基因组含量预测酶活性相关基因家族的相对丰度谱,结合已知的功能注释数据库,预测每个样本中各个酶的相对丰度谱;酶的相对丰度谱反映了肠道内酶的活性,构建酶-代谢物-人体肠道微生态健康状况的生物网络,根据相关功能酶活性进行人体肠道微生态健康的评估监控,以相关的酶活性变化反映人体肠道微生态健康状况。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 上海宝藤医学检验所有限公司 上海华藤生物科技有限公司 一种基于16S rRNA测序数据预测人体肠道健康状况的方法及其应用

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