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一种斑马鱼幼鱼荧光显微图像自动标注方法、系统、设备、介质 

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申请/专利权人:同济大学

摘要:本发明涉及一种斑马鱼幼鱼荧光显微图像自动标注方法、系统、设备、介质,其中标注方法包括:路径判别,接收用户输入的路径信息,并根据预设规则判断所述路径所指向的数据资源是否为图片文件的路径信息;图像转换;图像二值化,对经转换或已确认为灰度图像的荧光显微图像进行最大类间方差法处理,以生成仅包含前景像素与背景像素的二值化图像;边缘坐标提取,对生成的二值化图像应用边缘跟踪算法,以此识别并提取荧光区域的边界坐标及其对应的边界层级信息;标注文件输出。与现有技术相比,本发明可有效解决研究中斑马鱼幼鱼荧光显微图像手动标注的高误差、高成本的关键问题,为相关深度学习算法训练提供了高效便捷的标注方法。

主权项:1.一种斑马鱼幼鱼荧光显微图像自动标注方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:路径判别,接收用户输入的路径信息,并根据预设规则判断所述路径所指向的数据资源是否为图片文件的路径信息;S2:图像转换,若S1接收到的信息为图片文件的路径信息,则加载所述图片文件,并进一步判断所加载的荧光显微图像是否为灰度图像,若所加载的图像不是灰度图像,则执行将所述荧光图像转换为灰度图像的操作;S3:图像二值化,对经S2转换或已确认为灰度图像的荧光显微图像进行最大类间方差法处理,以生成仅包含前景像素与背景像素的二值化图像;S4:边缘坐标提取,对S3生成的二值化图像应用边缘跟踪算法,以此识别并提取荧光区域的边界坐标及其对应的边界层级信息;S5:标注文件输出,接收并整合S4中提取的边界坐标、边界层级信息,按照预定的深度学习算法标注格式进行组织,生成能够供深度学习模型训练使用的标注文件。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 同济大学 一种斑马鱼幼鱼荧光显微图像自动标注方法、系统、设备、介质

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