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申请/专利权人:江苏先声医学诊断有限公司
摘要:本申请涉及生信技术领域,具体提供一种基于LP‑WGS测序数据提取FDEMFDBM特征并进行PCC系统降噪的肺癌早筛模型构建及其应用。通过对血浆样本cfDNA进行全基因组低深度测序,对肺癌和健康人cfDNA进行高通量测序,从测序结果中提取新特征,并通过PCCPrincipalComponentCorrection,主成分校正方法对新特征进行背景降噪提高癌症信号的信噪比,从而构建高敏感型的区分肺癌和健康人的机器学习模型,最终实现对肺癌患者的高精确性的识别。
主权项:1.一种基于低深度测序数据提取FDEMFDBM特征并进行PCC系统降噪的肺癌早筛模型的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:1低深度全基因组测序数据获取和预处理;2提取cfDNA片段组特征FDEM和FDBM;所述FDEM为基于片段大小的4bp末端基序模式,所述FDBM为基于片段大小的4bp断点基序模式;3基于主成分分析PCC方法对特征矩阵进行背景降噪;4早筛模型的构建。
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百度查询: 江苏先声医学诊断有限公司 肺癌早筛模型及其应用
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